189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2596 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2596  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  201  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10240  Transposase  79.38 
 
 
97 aa  164  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1486  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.089931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0276  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1439  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0436436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3954  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0255  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0231  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1003  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2705  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1430  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3957  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0377  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0301  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0385  transposase IS3/IS911 family protein  78.35 
 
 
97 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3486  transposase IS3/IS911 family protein  77.32 
 
 
100 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  67.01 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  67.01 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 
100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3194  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
102 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960855  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  70.41 
 
 
95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  70.41 
 
 
95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  70.41 
 
 
95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06580  Transposase  70.41 
 
 
95 aa  130  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0602807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  69.39 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  69.39 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  69.39 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  69.39 
 
 
95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17910  Transposase  63.83 
 
 
101 aa  120  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.252162 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3241  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 
102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.680092  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3191  transposase IS3/IS911 family protein  68.04 
 
 
102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3179  transposase IS3/IS911  67.01 
 
 
115 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  61.7 
 
 
99 aa  115  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  61.7 
 
 
99 aa  115  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  61.7 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5590  transposase IS3/IS911  63.92 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302178  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5991  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160623 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  60.64 
 
 
99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  60.64 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0616  transposase IS3/IS911 family protein  62.89 
 
 
102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1095  transposase IS3/IS911 family protein  62.89 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5960  transposase IS3/IS911 family protein  62.89 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  58.51 
 
 
99 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05320  Transposase  61.86 
 
 
102 aa  103  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 
94 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3210  transposase IS3/IS911 family protein  55.79 
 
 
98 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2271  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  87  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2395  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  87  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2848  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  87  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.389181 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4507  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 
93 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  44.21 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  43.62 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5969  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  37.89 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25110  Transposase  35 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  29.9 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7354  transposase IS3/IS911 family protein  31.46 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1223  transposase IS3/IS911 family protein  28 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16285  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1221  transposase IS3/IS911 family protein  28 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.774632  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2447  transposase IS3/IS911 family protein  28 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000211632  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  28.87 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  27.66 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  27.66 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  29.9 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  29.9 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2593  transposase IS3/IS911  29.69 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1483  Fis family transcriptional regulator  29.69 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2637  Fis family transcriptional regulator  29.69 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470517  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0600  Fis family transcriptional regulator  29.69 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981407  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  29.23 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0946  Fis family transcriptional regulator  29.23 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  32.99 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2520  transposase IS3/IS911 family protein  29.47 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000790886  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3708  transposase IS3/IS911 family protein  29.47 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0112916  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13980  Transposase  30.77 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  31.88 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3286  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1232  hypothetical protein  30.93 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1297  hypothetical protein  30.93 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  26.32 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  29.17 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5972  transposase IS3/IS911 family protein  29.23 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.540441  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0739  transposase IS3/IS911 family protein  30.93 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>