More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1726 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 96 aa  194  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  65.62 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  65.62 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  63.54 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  64.58 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  51.61 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  51.61 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  49.46 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  49.46 
 
 		 99 aa  87.4  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  49.46 
 
 		 99 aa  87  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  49.46 
 
 		 99 aa  87  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  46.24 
 
 		 100 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7354  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06580  Transposase  43.01 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0602807  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3165  transposase IS3/IS911 family protein  44.94 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  45.65 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3633  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4507  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 		 93 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17910  Transposase  42.11 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.252162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3210  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2395  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10240  Transposase  46.46 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2848  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.389181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  44.19 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2271  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0231  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1439  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0436436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0377  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0255  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1486  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.089931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3957  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3954  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1003  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2705  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0276  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0301  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1430  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0385  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  40.22 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  40.22 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2596  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3486  transposase IS3/IS911 family protein  39.18 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  39.13 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  39.13 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0520  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0980  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.571542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0302  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0981  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.267655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1315  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0494436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1774  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0153  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0550  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0617  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.599694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4450  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.967947  normal  0.727343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0375  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1080  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1082  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2368  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2463  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>