269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17910 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_17910  Transposase  100 
 
 
101 aa  205  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.252162 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  66.34 
 
 
99 aa  130  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  66.34 
 
 
99 aa  130  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  64.36 
 
 
99 aa  128  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  64.36 
 
 
99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  64.36 
 
 
99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  68.09 
 
 
95 aa  126  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  68.09 
 
 
95 aa  126  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  68.09 
 
 
95 aa  126  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10240  Transposase  65.96 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  64.36 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  67.02 
 
 
95 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  67.02 
 
 
95 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  67.02 
 
 
95 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  67.02 
 
 
95 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  63.37 
 
 
100 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1430  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0385  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0255  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0231  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1439  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0436436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0276  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2705  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1003  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1486  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.089931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3957  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0301  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0377  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3954  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2596  transposase IS3/IS911 family protein  63.83 
 
 
97 aa  120  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3486  transposase IS3/IS911 family protein  59.57 
 
 
100 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3194  transposase IS3/IS911 family protein  56.44 
 
 
102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960855  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06580  Transposase  62.77 
 
 
95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0602807  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  56.44 
 
 
102 aa  117  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  56.44 
 
 
102 aa  117  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3241  transposase IS3/IS911 family protein  60.4 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.680092  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3191  transposase IS3/IS911 family protein  60.4 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3179  transposase IS3/IS911  59.41 
 
 
115 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05320  Transposase  64.89 
 
 
102 aa  104  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0616  transposase IS3/IS911 family protein  58.42 
 
 
102 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5590  transposase IS3/IS911  57.43 
 
 
102 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302178  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5991  transposase IS3/IS911 family protein  57.43 
 
 
102 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1095  transposase IS3/IS911 family protein  58.42 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5960  transposase IS3/IS911 family protein  58.42 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3210  transposase IS3/IS911 family protein  52 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  42.55 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4507  transposase IS3/IS911 family protein  48.35 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  41.49 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2395  transposase IS3/IS911 family protein  46.32 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2271  transposase IS3/IS911 family protein  46.32 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2848  transposase IS3/IS911 family protein  46.32 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.389181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  42.11 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25110  Transposase  38.83 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  35.56 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  44.93 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  44.93 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5969  transposase IS3/IS911 family protein  40.98 
 
 
115 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  44.93 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  37.5 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  43.94 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  40.58 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0302  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0981  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.267655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  42.03 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1774  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1315  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0494436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0980  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.571542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0153  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0520  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3165  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897924  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  34.02 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7354  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  40.58 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0550  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0617  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.599694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1320  transposase IS3/IS911 family protein  34.52 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  42.19 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  42.19 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  48 
 
 
492 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1221  transposase IS3/IS911 family protein  33.98 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.774632  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1223  transposase IS3/IS911 family protein  33.98 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16285  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2520  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000790886  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2447  transposase IS3/IS911 family protein  34.95 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000211632  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3708  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0112916  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  39.13 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  39.13 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  34.34 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>