More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1285 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
125 aa  256  9e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  62.3 
 
 
107 aa  136  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  62.9 
 
 
109 aa  135  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  62.9 
 
 
109 aa  135  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  60.8 
 
 
109 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  60.48 
 
 
109 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  59.84 
 
 
107 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  59.84 
 
 
107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  59.84 
 
 
107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  61.86 
 
 
107 aa  130  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  57.26 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  57.26 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  54.92 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  54.92 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  56.56 
 
 
108 aa  116  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  56.56 
 
 
108 aa  116  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  54.03 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  54.03 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  53.78 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  53.78 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 
108 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  55 
 
 
108 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 
108 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  50.81 
 
 
109 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  50.81 
 
 
112 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  50.81 
 
 
112 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  50.81 
 
 
109 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  50.81 
 
 
109 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  52.99 
 
 
107 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  52.1 
 
 
107 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  51.26 
 
 
107 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  51.26 
 
 
107 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  47.2 
 
 
108 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  47.2 
 
 
108 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  47.2 
 
 
108 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8280  hypothetical protein  54.81 
 
 
100 aa  98.6  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  48.74 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  50 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  47.2 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  53.77 
 
 
492 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  46.4 
 
 
113 aa  94  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  50 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  50 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  50 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  50 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  47.2 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  47.2 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  47.2 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  46.4 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  47.2 
 
 
108 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  47.2 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  45.6 
 
 
108 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5972  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
114 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.540441  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  45.6 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  45.6 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  44.8 
 
 
108 aa  84.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2097  hypothetical protein  41.32 
 
 
102 aa  84.3  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230614  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2593  transposase IS3/IS911  41.32 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1483  Fis family transcriptional regulator  41.32 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2637  Fis family transcriptional regulator  41.32 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470517  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0600  Fis family transcriptional regulator  41.32 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981407  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  41.32 
 
 
127 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0946  Fis family transcriptional regulator  41.32 
 
 
127 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25110  Transposase  40.34 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  46.61 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  40.68 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>