51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0626 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0626    100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05320  Transposase  90.67 
 
 		 309 bp  93.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0648  hypothetical protein  91.43 
 
 		 921 bp  91.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10240  Transposase  89.47 
 
 		 294 bp  87.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2596  transposase IS3/IS911 family protein  87.21 
 
 		 294 bp  83.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  83.93 
 
 		 303 bp  79.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1095  transposase IS3/IS911 family protein  88.73 
 
 		 309 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5960  transposase IS3/IS911 family protein  88.73 
 
 		 309 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3194  transposase IS3/IS911 family protein  86.59 
 
 		 309 bp  75.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  85.88 
 
 		 309 bp  73.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  85.88 
 
 		 309 bp  73.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0616  transposase IS3/IS911 family protein  88.24 
 
 		 309 bp  71.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06580  Transposase  84 
 
 		 288 bp  71.9  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0602807  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3957  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0231  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0255  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0276  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0301  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0377  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0385  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1003  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1430  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3954  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1439  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0436436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1486  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.089931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2705  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3484    86.96 
 
 		 2322 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3486  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 		 303 bp  65.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  86.57 
 
 		 288 bp  61.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  100 
 
 		 300 bp  61.9  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  100 
 
 		 300 bp  61.9  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  100 
 
 		 300 bp  61.9  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  86.57 
 
 		 288 bp  61.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  86.57 
 
 		 288 bp  61.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  86.57 
 
 		 288 bp  61.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  86.57 
 
 		 288 bp  61.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  86.57 
 
 		 288 bp  61.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  86.57 
 
 		 288 bp  61.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03390    91.3 
 
 		 1733 bp  60  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17910  Transposase  87.93 
 
 		 306 bp  60  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.252162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  96.97 
 
 		 285 bp  58  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  96.77 
 
 		 300 bp  54  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  96.77 
 
 		 300 bp  54  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  96.77 
 
 		 300 bp  54  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5590  transposase IS3/IS911  84.51 
 
 		 309 bp  54  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5969  transposase IS3/IS911 family protein  85.71 
 
 		 348 bp  54  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5991  transposase IS3/IS911 family protein  84.51 
 
 		 309 bp  54  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2848  transposase IS3/IS911 family protein  93.94 
 
 		 327 bp  50.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.389181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2395  transposase IS3/IS911 family protein  93.94 
 
 		 327 bp  50.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2271  transposase IS3/IS911 family protein  93.94 
 
 		 327 bp  50.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4507  transposase IS3/IS911 family protein  88.37 
 
 		 282 bp  46.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>