39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1061 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1061    100 
 
 		 234 bp  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  88.94 
 
 		 864 bp  240  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  88.94 
 
 		 864 bp  240  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3347    84.85 
 
 		 450 bp  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00644429  hitchhiker  0.000136105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0230    83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3485    83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3484    83.06 
 
 		 2322 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  83.06 
 
 		 900 bp  79.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  91.07 
 
 		 822 bp  71.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2569    95.45 
 
 		 513 bp  71.9  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  91.07 
 
 		 822 bp  71.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  91.07 
 
 		 822 bp  71.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  80.82 
 
 		 858 bp  67.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  91.67 
 
 		 384 bp  63.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  80.14 
 
 		 858 bp  60  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  80.99 
 
 		 888 bp  58  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 858 bp  58  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1164  hypothetical protein  84.93 
 
 		 141 bp  58  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  85.94 
 
 		 861 bp  56  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  80.15 
 
 		 666 bp  54  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  86.44 
 
 		 822 bp  54  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  86.44 
 
 		 822 bp  54  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  86.44 
 
 		 822 bp  54  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  86.44 
 
 		 828 bp  54  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  86.44 
 
 		 828 bp  54  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  96.67 
 
 		 396 bp  52  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  96.43 
 
 		 867 bp  48.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 696 bp  46.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>