32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1164 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1164  hypothetical protein  100 
 
 		 46 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  84.38 
 
 		 287 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  84.38 
 
 		 287 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  77.42 
 
 		 285 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  71.88 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  71.88 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  71.88 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  71.88 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  71.88 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  71.88 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  71.88 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  74.19 
 
 		 275 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  68.75 
 
 		 295 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  74.19 
 
 		 275 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  59.38 
 
 		 273 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  59.38 
 
 		 273 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  59.38 
 
 		 273 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  65.52 
 
 		 288 aa  45.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  71.43 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  61.36 
 
 		 288 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  61.29 
 
 		 293 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  61.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  61.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  61.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  61.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  61.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  61.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  61.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  55.81 
 
 		 288 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  68.75 
 
 		 290 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  68.75 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  65.62 
 
 		 290 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>