47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0230 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0230    100 
 
 		 900 bp  1784    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3484    100 
 
 		 2322 bp  1784    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  99.89 
 
 		 900 bp  1776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3485    100 
 
 		 900 bp  1784    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 822 bp  131  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 822 bp  131  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  86.96 
 
 		 822 bp  131  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  83.53 
 
 		 864 bp  115  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  83.53 
 
 		 864 bp  115  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  84.85 
 
 		 858 bp  103  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  87.25 
 
 		 666 bp  99.6  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  84.09 
 
 		 384 bp  95.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  87 
 
 		 888 bp  95.6  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  82.89 
 
 		 861 bp  95.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  84.09 
 
 		 858 bp  95.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 		 858 bp  91.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  83.33 
 
 		 396 bp  87.7  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  82.86 
 
 		 873 bp  87.7  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21070    82.86 
 
 		 288 bp  87.7  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.866093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23470    82.86 
 
 		 844 bp  87.7  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05310    87.37 
 
 		 830 bp  85.7  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  93.1 
 
 		 822 bp  83.8  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  93.1 
 
 		 822 bp  83.8  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  93.1 
 
 		 822 bp  83.8  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  82.14 
 
 		 873 bp  79.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    82.14 
 
 		 2354 bp  79.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1061    83.06 
 
 		 234 bp  79.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  81.56 
 
 		 828 bp  73.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  81.56 
 
 		 828 bp  73.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  81.43 
 
 		 873 bp  71.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10250  hypothetical protein  87.5 
 
 		 147 bp  71.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5968    81.54 
 
 		 821 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 867 bp  56  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2569    96.77 
 
 		 513 bp  54  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17900    81.44 
 
 		 888 bp  50.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  85.96 
 
 		 867 bp  50.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>