66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2569 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2569    100 
 
 		 513 bp  1017    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 		 822 bp  139  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 		 822 bp  139  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 		 822 bp  139  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  88.28 
 
 		 666 bp  135  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20160  transposase  86.86 
 
 		 873 bp  129  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.204187  normal  0.0283567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21070    86.86 
 
 		 288 bp  129  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.866093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23470    86.86 
 
 		 844 bp  129  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  82.22 
 
 		 861 bp  129  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  87.3 
 
 		 888 bp  123  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    86.13 
 
 		 2354 bp  121  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23540  transposase  86.13 
 
 		 873 bp  121  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  81.9 
 
 		 858 bp  115  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  81.9 
 
 		 864 bp  115  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  81.9 
 
 		 864 bp  115  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  81.9 
 
 		 858 bp  115  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  81.9 
 
 		 828 bp  115  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  81.9 
 
 		 828 bp  115  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18720  transposase  85.4 
 
 		 873 bp  113  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5968    81.43 
 
 		 821 bp  107  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  81.43 
 
 		 858 bp  107  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  84.4 
 
 		 396 bp  105  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  80.95 
 
 		 384 bp  99.6  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4506  Integrase catalytic region  88.51 
 
 		 867 bp  93.7  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.126933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1061    95.45 
 
 		 234 bp  71.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05310    86.21 
 
 		 830 bp  69.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2272  Integrase catalytic region  81.2 
 
 		 822 bp  65.9  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2396  Integrase catalytic region  81.2 
 
 		 822 bp  65.9  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2849  Integrase catalytic region  81.2 
 
 		 822 bp  65.9  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06570  transposase  85.71 
 
 		 882 bp  65.9  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0131  Integrase catalytic region  90.2 
 
 		 882 bp  61.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1242  Integrase catalytic region  90.2 
 
 		 882 bp  61.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0782123  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0628  Integrase catalytic region  90.2 
 
 		 882 bp  61.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2066  Integrase catalytic region  90.2 
 
 		 882 bp  61.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000236626  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2873  Integrase catalytic region  90.2 
 
 		 882 bp  61.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000164052  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3497  Integrase catalytic region  90.2 
 
 		 882 bp  61.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045245  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4462  Integrase catalytic region  90.2 
 
 		 882 bp  61.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  100 
 
 		 837 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  100 
 
 		 837 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  96.88 
 
 		 867 bp  56  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 837 bp  54  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3484    96.77 
 
 		 2322 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3485    96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0230    96.77 
 
 		 900 bp  54  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3347    89.13 
 
 		 450 bp  52  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00644429  hitchhiker  0.000136105 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17900    100 
 
 		 888 bp  50.1  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03410  transposase  85.96 
 
 		 867 bp  50.1  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1164  hypothetical protein  96.55 
 
 		 141 bp  50.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21090    82.89 
 
 		 693 bp  48.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4384    90 
 
 		 833 bp  48.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0615  transposase subunit  85.45 
 
 		 465 bp  46.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0941    96.3 
 
 		 417 bp  46.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  96.3 
 
 		 837 bp  46.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1117    96.3 
 
 		 414 bp  46.1  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>