43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1117 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1117    100 
 
 		 414 bp  821    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0941    99.76 
 
 		 417 bp  813    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  100 
 
 		 837 bp  821    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  85.16 
 
 		 837 bp  87.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  85.16 
 
 		 837 bp  87.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  81.82 
 
 		 810 bp  77.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  81.82 
 
 		 837 bp  77.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  81.82 
 
 		 837 bp  77.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  81.82 
 
 		 837 bp  77.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  87.18 
 
 		 837 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  87.18 
 
 		 837 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  87.18 
 
 		 837 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  87.18 
 
 		 783 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  87.18 
 
 		 837 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  87.18 
 
 		 837 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1165  integrase catalytic region  87.18 
 
 		 669 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  87.18 
 
 		 837 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  87.18 
 
 		 837 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  87.18 
 
 		 837 bp  75.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  85.9 
 
 		 807 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  85.9 
 
 		 807 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  85.9 
 
 		 807 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  85.9 
 
 		 807 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  87.69 
 
 		 837 bp  65.9  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  95.12 
 
 		 834 bp  65.9  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  95.12 
 
 		 834 bp  65.9  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  95.12 
 
 		 834 bp  65.9  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 858 bp  52  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 858 bp  52  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  96.3 
 
 		 861 bp  46.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  96.3 
 
 		 888 bp  46.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2569    96.3 
 
 		 513 bp  46.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  96.3 
 
 		 858 bp  46.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5968    96.3 
 
 		 821 bp  46.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4900  hypothetical protein  96.3 
 
 		 468 bp  46.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.201939  normal  0.185288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>