40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17900 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17900    100 
 
 		 888 bp  1760    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2595  Integrase catalytic region  94.64 
 
 		 888 bp  87.7  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3645  Integrase catalytic region  82.48 
 
 		 861 bp  81.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 828 bp  77.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 828 bp  77.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10250  hypothetical protein  83.64 
 
 		 147 bp  75.8  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  83.64 
 
 		 858 bp  75.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  90.16 
 
 		 858 bp  73.8  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5968    85.57 
 
 		 821 bp  73.8  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  90.16 
 
 		 858 bp  73.8  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  81.75 
 
 		 822 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  81.75 
 
 		 822 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0625    82.73 
 
 		 396 bp  67.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  81.75 
 
 		 822 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  88.14 
 
 		 864 bp  61.9  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  88.14 
 
 		 864 bp  61.9  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  80.43 
 
 		 666 bp  60  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  86.67 
 
 		 384 bp  56  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3484    81.55 
 
 		 2322 bp  54  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  93.48 
 
 		 867 bp  52  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0603  integrase, catalytic region  87.04 
 
 		 396 bp  52  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0300  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3958  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3955  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3485    81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2706  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1485  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1438  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1429  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1004  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0384  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0378  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  100 
 
 		 837 bp  50.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0277  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0254  Integrase catalytic region  81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.59969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0230    81.44 
 
 		 900 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2569    100 
 
 		 513 bp  50.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 837 bp  50.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 1560 bp  50.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  100 
 
 		 837 bp  50.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>