11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3347 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3347    100 
 
 		 450 bp  892    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00644429  hitchhiker  0.000136105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1932  integrase catalytic subunit  86.39 
 
 		 864 bp  147  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00436726  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3351  integrase catalytic subunit  86.39 
 
 		 864 bp  147  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1061    84.85 
 
 		 234 bp  123  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1164  hypothetical protein  85.94 
 
 		 141 bp  56  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0604  transposase subunit  94.29 
 
 		 384 bp  54  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2569    89.13 
 
 		 513 bp  52  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1094  integrase catalytic subunit  93.94 
 
 		 858 bp  50.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5959  integrase catalytic subunit  93.94 
 
 		 858 bp  50.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3195  integrase catalytic subunit  93.94 
 
 		 858 bp  50.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0240069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3211  integrase catalytic subunit  91.43 
 
 		 867 bp  46.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>