70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2656 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2669    97.85 
 
 		 3924 bp  1518    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    100 
 
 		 2569 bp  2706    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    100 
 
 		 5675 bp  2706    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0367  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0714    100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0737  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0364  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2588  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2656    100 
 
 		 2656 bp  5265    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0819  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2658  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1173  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2801  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1177  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4660  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4726    86.91 
 
 		 3918 bp  771    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1180    100 
 
 		 615 bp  1090    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1182    100 
 
 		 1749 bp  1126    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1501  Integrase catalytic region  87.72 
 
 		 969 bp  977    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1739  Integrase catalytic region  100 
 
 		 969 bp  1921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0682469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2587  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2800  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4659  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 318 bp  630  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  99.69 
 
 		 318 bp  622  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  99.69 
 
 		 318 bp  622  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2583    83.65 
 
 		 3939 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0739  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  569  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4729  transposase IS3/IS911 family protein  89.17 
 
 		 318 bp  353  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  95.58 
 
 		 318 bp  184  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 1227 bp  170  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  100 
 
 		 1428 bp  170  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  100 
 
 		 4032 bp  170  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  78.94 
 
 		 963 bp  153  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4730    93.02 
 
 		 468 bp  123  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  92.13 
 
 		 318 bp  121  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2655  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 531 bp  99.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2457    88.41 
 
 		 893 bp  73.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2845    88.41 
 
 		 965 bp  73.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  95 
 
 		 1524 bp  63.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1309    97.14 
 
 		 158 bp  61.9  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  94.74 
 
 		 1506 bp  60  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  94.74 
 
 		 1578 bp  60  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  97.06 
 
 		 1503 bp  60  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  94.74 
 
 		 1533 bp  60  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  92.5 
 
 		 1557 bp  56  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  94.44 
 
 		 1512 bp  56  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  92.5 
 
 		 936 bp  56  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  92.31 
 
 		 1563 bp  54  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  94.29 
 
 		 1512 bp  54  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17790  Transposase  83.54 
 
 		 321 bp  54  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.837137  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  90.48 
 
 		 1515 bp  52  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  94.12 
 
 		 327 bp  52  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  87.04 
 
 		 1437 bp  52  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  92.11 
 
 		 1506 bp  52  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  96.67 
 
 		 1626 bp  52  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0503    82.98 
 
 		 256 bp  52  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00200956  normal  0.0242434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  92.11 
 
 		 1578 bp  52  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  91.89 
 
 		 1611 bp  50.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  96.55 
 
 		 1545 bp  50.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  93.94 
 
 		 705 bp  50.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  91.89 
 
 		 1509 bp  50.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  93.94 
 
 		 327 bp  50.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  96.55 
 
 		 330 bp  50.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>