23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1309 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1309    100 
 
 
158 bp  313  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  93.48 
 
 
963 bp  67.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2583    100 
 
 
3939 bp  65.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1501  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4660  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2801  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2658  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2656    97.14 
 
 
2656 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2588  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1739  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0682469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1177  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1173  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0819  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0737  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0714    97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    97.14 
 
 
2569 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    97.14 
 
 
5675 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0367  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0364  Integrase catalytic region  97.14 
 
 
969 bp  61.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2457    86.36 
 
 
893 bp  60  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2845    86.36 
 
 
965 bp  60  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2669    96.97 
 
 
3924 bp  58  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  92.31 
 
 
936 bp  54  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>