More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1173 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2658  Integrase catalytic region  100 
 
 		 322 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2588  Integrase catalytic region  100 
 
 		 322 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0819  Integrase catalytic region  100 
 
 		 322 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0737  Integrase catalytic region  100 
 
 		 322 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0364  Integrase catalytic region  100 
 
 		 322 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0367  Integrase catalytic region  100 
 
 		 322 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1177  Integrase catalytic region  100 
 
 		 322 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1739  Integrase catalytic region  100 
 
 		 322 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0682469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1173  Integrase catalytic region  100 
 
 		 322 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4660  Integrase catalytic region  100 
 
 		 322 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2801  Integrase catalytic region  100 
 
 		 322 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1501  Integrase catalytic region  92.55 
 
 		 322 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  70.42 
 
 		 320 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  54.15 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  51.19 
 
 		 301 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  51.19 
 
 		 301 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  51.19 
 
 		 301 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  51.2 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  49.83 
 
 		 303 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  51.43 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  52.17 
 
 		 278 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  49.67 
 
 		 301 aa  272  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  49.35 
 
 		 301 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  50.5 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  50.5 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  49.5 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  51.22 
 
 		 282 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  51.22 
 
 		 282 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  49.51 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  49.51 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  50.18 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  51.44 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  48.37 
 
 		 301 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  47.35 
 
 		 304 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  48.37 
 
 		 301 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  47.21 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  48.85 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  53.01 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  53.01 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  53.01 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  53.01 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  47.51 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  53.01 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  48.85 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  50.36 
 
 		 283 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  47.16 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  47.16 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  49.64 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  49.64 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  49.64 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  49.64 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  46.49 
 
 		 296 aa  251  9.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  45.63 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  47.81 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  45.63 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  46.82 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  47.47 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  47.47 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  47.47 
 
 		 301 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  46.15 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  46.49 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  46.15 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  46.15 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  46.15 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  45.72 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  46.15 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  50.36 
 
 		 282 aa  245  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  50.36 
 
 		 282 aa  245  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>