43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2583 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  100 
 
 		 975 bp  1933    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  100 
 
 		 975 bp  1933    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  99.89 
 
 		 1827 bp  3606    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4726    96.13 
 
 		 3918 bp  6445    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2669    96.33 
 
 		 3924 bp  6554    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  99.95 
 
 		 1827 bp  3614    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  100 
 
 		 975 bp  1933    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  100 
 
 		 1827 bp  3622    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2583    100 
 
 		 3939 bp  7808    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1501  Integrase catalytic region  84.62 
 
 		 969 bp  634  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0737  Integrase catalytic region  83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    83.65 
 
 		 2569 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0819  Integrase catalytic region  83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1173  Integrase catalytic region  83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1177  Integrase catalytic region  83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1739  Integrase catalytic region  83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0682469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2588  Integrase catalytic region  83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2656    83.65 
 
 		 2656 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2658  Integrase catalytic region  83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0714    83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    83.65 
 
 		 5675 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0367  Integrase catalytic region  83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0364  Integrase catalytic region  83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2801  Integrase catalytic region  83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4660  Integrase catalytic region  83.65 
 
 		 969 bp  571  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1180    84.53 
 
 		 615 bp  400  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1182    84.53 
 
 		 1749 bp  400  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  80.27 
 
 		 963 bp  155  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3707    79.95 
 
 		 1855 bp  153  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251873  normal  0.277887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  79.95 
 
 		 1854 bp  153  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  79.95 
 
 		 1854 bp  153  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  85.42 
 
 		 1005 bp  79.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  85.42 
 
 		 1005 bp  79.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  85.42 
 
 		 1005 bp  79.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1309    100 
 
 		 158 bp  65.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2845    87.3 
 
 		 965 bp  61.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2457    87.3 
 
 		 893 bp  61.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  86.36 
 
 		 912 bp  60  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 858 bp  52  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 858 bp  52  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 858 bp  52  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  96.67 
 
 		 858 bp  52  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  96.67 
 
 		 858 bp  52  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>