51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0064 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0064    100 
 
 		 594 bp  1178    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  84.68 
 
 		 936 bp  85.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  84.91 
 
 		 867 bp  83.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  88.33 
 
 		 657 bp  63.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  82.24 
 
 		 927 bp  61.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  83.72 
 
 		 735 bp  60  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  83.72 
 
 		 906 bp  60  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    100 
 
 		 2253 bp  60  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2031    100 
 
 		 480 bp  60  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  81.73 
 
 		 849 bp  56  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  81.73 
 
 		 849 bp  56  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1639  integrase catalytic subunit  81.73 
 
 		 570 bp  56  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1665    81.73 
 
 		 997 bp  56  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1612    81.73 
 
 		 997 bp  56  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    86.44 
 
 		 2354 bp  54  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13130    96.67 
 
 		 2027 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000997502  normal  0.0691909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12415    96.67 
 
 		 1916 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000185069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12047    96.67 
 
 		 2615 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11738    96.67 
 
 		 1775 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.28559e-27  normal  0.52056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  96.67 
 
 		 837 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  96.67 
 
 		 885 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  93.94 
 
 		 963 bp  50.1  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2446  Integrase catalytic region  100 
 
 		 939 bp  50.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000102431  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1224  Integrase catalytic region  100 
 
 		 939 bp  50.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.401317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1220  Integrase catalytic region  100 
 
 		 939 bp  50.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1219    100 
 
 		 2912 bp  50.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.592075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  91.89 
 
 		 849 bp  50.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 906 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 906 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3405    93.94 
 
 		 2281 bp  50.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  83.12 
 
 		 912 bp  50.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  91.89 
 
 		 849 bp  50.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2845    81.25 
 
 		 965 bp  48.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2457    81.25 
 
 		 893 bp  48.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  82.14 
 
 		 900 bp  48.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  82.14 
 
 		 900 bp  48.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>