121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0515 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0515    100 
 
 		 1415 bp  2805    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0167322  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2013    98 
 
 		 150 bp  274  7e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  88.57 
 
 		 1401 bp  113  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    93.33 
 
 		 2354 bp  109  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  93.33 
 
 		 1398 bp  109  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  88.66 
 
 		 981 bp  105  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2754    87.62 
 
 		 1400 bp  105  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  87.23 
 
 		 1272 bp  91.7  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  87.23 
 
 		 1272 bp  91.7  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  87.23 
 
 		 1272 bp  91.7  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  87.23 
 
 		 1272 bp  91.7  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  87.23 
 
 		 1272 bp  91.7  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0368  integrase catalytic subunit  90.14 
 
 		 579 bp  85.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.810172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4442  transposase, ISlxx5  93.22 
 
 		 285 bp  85.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1374 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1374 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3877    94.44 
 
 		 2364 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1841    94.44 
 
 		 2619 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.348274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1374 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1374 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1374 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1374 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1374 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2953    94.44 
 
 		 2534 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.100648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1374 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1374 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1374 bp  83.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  85 
 
 		 1440 bp  79.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    85 
 
 		 2253 bp  79.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  85 
 
 		 1440 bp  79.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  85 
 
 		 1440 bp  79.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  85 
 
 		 1362 bp  79.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  92.59 
 
 		 1560 bp  75.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  92.59 
 
 		 1491 bp  75.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  92.59 
 
 		 1560 bp  75.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  92.59 
 
 		 1578 bp  75.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  92.59 
 
 		 1560 bp  75.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  92.59 
 
 		 1560 bp  75.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  92.59 
 
 		 1560 bp  75.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3263  integrase  85.06 
 
 		 570 bp  69.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1722    84.62 
 
 		 3771 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1446 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2800    84.62 
 
 		 3468 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    84.62 
 
 		 2015 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1401 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  90.74 
 
 		 1020 bp  67.9  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  90.74 
 
 		 1020 bp  67.9  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  90.74 
 
 		 1020 bp  67.9  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  83.87 
 
 		 1443 bp  65.9  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  83.87 
 
 		 1443 bp  65.9  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  87.69 
 
 		 1227 bp  65.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1864    83.7 
 
 		 1154 bp  63.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0429575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  84.09 
 
 		 1158 bp  63.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  84.09 
 
 		 1158 bp  63.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3625  integrase, catalytic region  85.33 
 
 		 249 bp  61.9  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290027  normal  0.12357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 981 bp  60  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 981 bp  60  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 981 bp  60  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 981 bp  60  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4114  hypothetical protein  86.15 
 
 		 834 bp  58  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 1113 bp  58  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  90.91 
 
 		 1029 bp  56  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  90.91 
 
 		 1029 bp  56  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  90.91 
 
 		 1029 bp  56  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  90.91 
 
 		 1029 bp  56  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  90.91 
 
 		 1029 bp  56  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  90.91 
 
 		 1029 bp  56  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  90.91 
 
 		 1029 bp  56  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  90.91 
 
 		 1029 bp  56  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  90.91 
 
 		 1029 bp  56  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 1425 bp  54  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 1245 bp  54  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 1425 bp  54  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 1314 bp  54  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 1314 bp  54  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 1425 bp  54  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 1314 bp  54  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 1314 bp  54  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1200 bp  54  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 1200 bp  54  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0118  hypothetical protein  83.54 
 
 		 387 bp  54  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1915    83.52 
 
 		 1400 bp  54  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.590164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2930    83.52 
 
 		 1400 bp  54  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  90.7 
 
 		 1266 bp  54  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    85.71 
 
 		 5675 bp  54  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    85.71 
 
 		 2569 bp  54  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3422  Integrase catalytic region  86.21 
 
 		 1017 bp  52  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2436  Integrase catalytic region  86.21 
 
 		 1017 bp  52  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>