68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1915 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1915    100 
 
 		 1400 bp  2775    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.590164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1722    99.93 
 
 		 3771 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2800    99.93 
 
 		 3468 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  99.86 
 
 		 1401 bp  2753    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2930    100 
 
 		 1400 bp  2775    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    99.93 
 
 		 2015 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1401 bp  2761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  99.79 
 
 		 1401 bp  2746    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  99.93 
 
 		 1446 bp  2698    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  91.55 
 
 		 1209 bp  93.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0476  IS30 family transposase  91.55 
 
 		 903 bp  93.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    93.22 
 
 		 2354 bp  85.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  93.22 
 
 		 1398 bp  85.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1841    85.44 
 
 		 2619 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.348274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2953    85.44 
 
 		 2534 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.100648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3877    85.44 
 
 		 2364 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  85.44 
 
 		 1374 bp  85.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  89.83 
 
 		 1362 bp  69.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  90.38 
 
 		 1113 bp  63.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  88.14 
 
 		 1266 bp  61.9  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    87.1 
 
 		 2569 bp  60  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    87.1 
 
 		 5675 bp  60  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  83.72 
 
 		 1272 bp  60  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 1440 bp  58  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  88.68 
 
 		 1443 bp  58  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  88.68 
 
 		 1443 bp  58  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 1440 bp  58  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    86.15 
 
 		 2253 bp  58  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 1440 bp  58  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0118  hypothetical protein  86.44 
 
 		 387 bp  54  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  83.13 
 
 		 981 bp  54  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  94.29 
 
 		 1158 bp  54  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0515    83.52 
 
 		 1415 bp  54  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0167322  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  94.29 
 
 		 1158 bp  54  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 		 1161 bp  52  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 		 1161 bp  52  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3422  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 1017 bp  50.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2436  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 1017 bp  50.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0439  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 1017 bp  50.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1864    88.89 
 
 		 1154 bp  50.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0429575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2699  response regulator receiver  96.43 
 
 		 4113 bp  48.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641712  normal  0.15072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2754    93.75 
 
 		 1400 bp  48.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4442  transposase, ISlxx5  85 
 
 		 285 bp  48.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  100 
 
 		 2232 bp  48.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 1401 bp  48.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>