More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0368 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0368  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.810172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  68.42 
 
 		 519 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  68.42 
 
 		 496 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  68.42 
 
 		 519 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  68.42 
 
 		 519 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  68.42 
 
 		 525 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  67.76 
 
 		 519 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  67.76 
 
 		 519 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  64.67 
 
 		 457 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  64.67 
 
 		 457 aa  210  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  64.67 
 
 		 457 aa  210  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  64.67 
 
 		 457 aa  210  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  64.67 
 
 		 457 aa  210  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  64.67 
 
 		 457 aa  210  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  64.67 
 
 		 457 aa  210  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  64.67 
 
 		 457 aa  210  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  64.67 
 
 		 457 aa  210  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  64.67 
 
 		 457 aa  210  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  58.94 
 
 		 385 aa  202  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  58.94 
 
 		 385 aa  201  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  53.59 
 
 		 423 aa  200  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  53.59 
 
 		 423 aa  200  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  53.59 
 
 		 423 aa  200  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  53.59 
 
 		 423 aa  200  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  53.59 
 
 		 423 aa  200  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  57.24 
 
 		 326 aa  191  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  58.44 
 
 		 408 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  56.89 
 
 		 402 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  57.89 
 
 		 342 aa  185  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  60.78 
 
 		 342 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  60.78 
 
 		 342 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  60.78 
 
 		 342 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  60.78 
 
 		 342 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  60.78 
 
 		 342 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  60.78 
 
 		 342 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  60.78 
 
 		 342 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  60.78 
 
 		 342 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  60.78 
 
 		 342 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  53.49 
 
 		 465 aa  181  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 386 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  56.58 
 
 		 386 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  55.26 
 
 		 386 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  55.49 
 
 		 386 aa  180  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  58.55 
 
 		 386 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3263  integrase  54.61 
 
 		 189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  53.9 
 
 		 386 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  56.21 
 
 		 401 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 		 401 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  58.94 
 
 		 386 aa  178  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  52.63 
 
 		 465 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  52.63 
 
 		 465 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  52.63 
 
 		 465 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  52.63 
 
 		 465 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  52.63 
 
 		 465 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  52.63 
 
 		 465 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  53.95 
 
 		 386 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  53.95 
 
 		 386 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  52.05 
 
 		 465 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  53.37 
 
 		 466 aa  171  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  58 
 
 		 253 aa  171  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  54 
 
 		 380 aa  170  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  51.12 
 
 		 474 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  53.29 
 
 		 414 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  51.12 
 
 		 474 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  53.29 
 
 		 437 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  53.29 
 
 		 437 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  51.12 
 
 		 474 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  53.29 
 
 		 437 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  53.29 
 
 		 437 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  53.89 
 
 		 479 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  53.89 
 
 		 479 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  53.89 
 
 		 479 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  54.9 
 
 		 399 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  54.9 
 
 		 399 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  53.59 
 
 		 343 aa  168  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  54.97 
 
 		 339 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  54.97 
 
 		 339 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  54.97 
 
 		 339 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  50 
 
 		 385 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 481 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 466 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  53.29 
 
 		 480 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 		 380 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  50 
 
 		 385 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  53.29 
 
 		 480 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  51.63 
 
 		 317 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0756  Integrase catalytic region  51.63 
 
 		 338 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  50 
 
 		 385 aa  165  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>