19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2031 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3565  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 753 bp  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2753  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 762 bp  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    100 
 
 		 2253 bp  952    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1091    100 
 
 		 966 bp  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1592  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 753 bp  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2031    100 
 
 		 480 bp  952    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0064    100 
 
 		 594 bp  60  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7300    94.59 
 
 		 562 bp  58  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130484  hitchhiker  0.00884242 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5987  hypothetical protein  89.8 
 
 		 765 bp  58  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129837 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  93.94 
 
 		 606 bp  50.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  85.96 
 
 		 906 bp  50.1  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  85.96 
 
 		 906 bp  50.1  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5602  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  91.67 
 
 		 831 bp  48.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.384176  normal  0.976486 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5431  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  91.67 
 
 		 831 bp  48.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.15452 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5828  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  91.67 
 
 		 831 bp  48.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313966 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  88.64 
 
 		 906 bp  48.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6003  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  91.67 
 
 		 831 bp  48.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000813488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  88.64 
 
 		 906 bp  48.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3405    100 
 
 		 2281 bp  46.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>