More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1467 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1467  transposase, ISlxx5  100 
 
 		 94 aa  196  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4442  transposase, ISlxx5  95.74 
 
 		 94 aa  171  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  61.9 
 
 		 326 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  65.85 
 
 		 457 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  65.85 
 
 		 457 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  65.85 
 
 		 457 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  65.85 
 
 		 457 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  65.85 
 
 		 457 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  65.85 
 
 		 457 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  65.85 
 
 		 457 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  65.85 
 
 		 457 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  65.85 
 
 		 457 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  65.85 
 
 		 457 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  64.29 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  64.29 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  64.29 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  64.29 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  64.29 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  63.1 
 
 		 519 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  63.1 
 
 		 519 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0368  integrase catalytic subunit  62.65 
 
 		 192 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.810172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3263  integrase  58.33 
 
 		 189 aa  114  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  58.33 
 
 		 342 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  55.32 
 
 		 465 aa  110  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  57.83 
 
 		 385 aa  110  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  58.14 
 
 		 408 aa  110  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  56.38 
 
 		 402 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  58.14 
 
 		 386 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  57.83 
 
 		 385 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  58.33 
 
 		 386 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  55.32 
 
 		 453 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 		 386 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 		 479 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 		 479 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 		 479 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  53.19 
 
 		 465 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 386 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  53.19 
 
 		 465 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  57.14 
 
 		 386 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  53.19 
 
 		 465 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  53.19 
 
 		 465 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  53.19 
 
 		 465 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  53.19 
 
 		 465 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  57.83 
 
 		 339 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  57.83 
 
 		 339 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  57.83 
 
 		 339 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  55.95 
 
 		 386 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  55.95 
 
 		 386 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  54.26 
 
 		 466 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  56.63 
 
 		 386 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  55.81 
 
 		 383 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  55.81 
 
 		 354 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  55.81 
 
 		 383 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  55.81 
 
 		 383 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  55.81 
 
 		 383 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  56.63 
 
 		 385 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  55.81 
 
 		 383 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  55.81 
 
 		 383 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  55.81 
 
 		 383 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  52.13 
 
 		 465 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  54.95 
 
 		 342 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  54.95 
 
 		 342 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  54.95 
 
 		 342 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  54.95 
 
 		 342 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  54.95 
 
 		 342 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  54.95 
 
 		 342 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  54.95 
 
 		 342 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  54.95 
 
 		 342 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  54.95 
 
 		 342 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 437 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 437 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 437 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 437 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  53.26 
 
 		 326 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  55.42 
 
 		 385 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  53.26 
 
 		 326 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 474 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 414 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 474 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 474 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  53.26 
 
 		 326 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  55.42 
 
 		 385 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  53.26 
 
 		 326 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  53.93 
 
 		 340 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  54.95 
 
 		 480 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  54.95 
 
 		 480 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  57.32 
 
 		 253 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 386 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  55 
 
 		 380 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0118  hypothetical protein  53.01 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19217  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  52.44 
 
 		 342 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  52.44 
 
 		 342 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  58.11 
 
 		 342 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  48.84 
 
 		 343 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13211  transposase  52.33 
 
 		 394 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  60.47 
 
 		 466 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  60.47 
 
 		 466 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  53.75 
 
 		 380 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  60.47 
 
 		 466 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  60.47 
 
 		 466 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>