36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0536 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0536    100 
 
 		 456 bp  904    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0539  transposase  99.67 
 
 		 300 bp  587  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  84.56 
 
 		 906 bp  188  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  84.56 
 
 		 906 bp  188  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  89.42 
 
 		 906 bp  119  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  89.42 
 
 		 906 bp  119  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  81.99 
 
 		 735 bp  89.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  84.69 
 
 		 900 bp  75.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  84.69 
 
 		 900 bp  75.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  84.78 
 
 		 906 bp  71.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    85.71 
 
 		 2015 bp  65.9  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  85.92 
 
 		 906 bp  61.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6829    83.75 
 
 		 255 bp  56  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  80 
 
 		 906 bp  56  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  80 
 
 		 906 bp  56  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1295    82.29 
 
 		 279 bp  56  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8255  transposase  83.33 
 
 		 369 bp  56  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0325797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  88.24 
 
 		 450 bp  54  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  88.24 
 
 		 906 bp  54  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  88.24 
 
 		 906 bp  54  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 855 bp  54  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    88.24 
 
 		 906 bp  54  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  88.24 
 
 		 906 bp  54  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 855 bp  54  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 855 bp  54  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 855 bp  54  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2177  hypothetical protein  92.31 
 
 		 252 bp  54  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  88 
 
 		 906 bp  52  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    82.5 
 
 		 943 bp  48.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  86.27 
 
 		 906 bp  46.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    81.32 
 
 		 912 bp  46.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  81.32 
 
 		 852 bp  46.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    84.75 
 
 		 2389 bp  46.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  84.75 
 
 		 906 bp  46.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  84.75 
 
 		 906 bp  46.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  84.75 
 
 		 906 bp  46.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>