69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3929 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3929    100 
 
 		 216 bp  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2687    84.8 
 
 		 267 bp  159  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7785  integrase catalytic region  89.84 
 
 		 135 bp  151  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00395813  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  83.49 
 
 		 906 bp  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  83.49 
 
 		 906 bp  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1445    83.15 
 
 		 324 bp  119  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    84.67 
 
 		 943 bp  105  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  84.33 
 
 		 906 bp  99.6  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  84.33 
 
 		 906 bp  99.6  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  83.56 
 
 		 906 bp  99.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6829    81.28 
 
 		 255 bp  93.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  98 
 
 		 900 bp  91.7  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  98 
 
 		 900 bp  91.7  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  85.32 
 
 		 906 bp  89.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    85.32 
 
 		 2015 bp  89.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  85.32 
 
 		 906 bp  89.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7786  hypothetical protein  96.15 
 
 		 324 bp  87.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3384  hypothetical protein  84.68 
 
 		 345 bp  85.7  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  89.04 
 
 		 906 bp  81.8  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1295    88 
 
 		 279 bp  77.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    84.69 
 
 		 802 bp  75.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  93.88 
 
 		 774 bp  73.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  92 
 
 		 300 bp  67.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  92.86 
 
 		 450 bp  60  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  92.86 
 
 		 906 bp  60  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  92.86 
 
 		 906 bp  60  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    92.86 
 
 		 906 bp  60  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  92.86 
 
 		 906 bp  60  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  92.68 
 
 		 849 bp  58  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  92.68 
 
 		 849 bp  58  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1815  hypothetical protein  88.46 
 
 		 309 bp  56  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5392    89.36 
 
 		 124 bp  54  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  89.13 
 
 		 858 bp  52  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  89.13 
 
 		 858 bp  52  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  89.13 
 
 		 858 bp  52  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  90.48 
 
 		 906 bp  52  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  89.13 
 
 		 858 bp  52  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  90.48 
 
 		 915 bp  52  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  89.13 
 
 		 858 bp  52  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  90.48 
 
 		 915 bp  52  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  90.24 
 
 		 906 bp  50.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  90.24 
 
 		 906 bp  50.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  90.24 
 
 		 906 bp  50.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    90.24 
 
 		 2389 bp  50.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0539  transposase  80.73 
 
 		 300 bp  50.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12047    89.74 
 
 		 2615 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1015    93.55 
 
 		 351 bp  46.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000847594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  89.74 
 
 		 837 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 876 bp  46.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11738    89.74 
 
 		 1775 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.28559e-27  normal  0.52056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12415    89.74 
 
 		 1916 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000185069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13130    89.74 
 
 		 2027 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000997502  normal  0.0691909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1895    86.27 
 
 		 162 bp  46.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912531  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  89.74 
 
 		 885 bp  46.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>