99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12415 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11780  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  100 
 
 		 837 bp  1659    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11738    100 
 
 		 1775 bp  2686    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.28559e-27  normal  0.52056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12047    100 
 
 		 2615 bp  2688    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13130    100 
 
 		 2027 bp  2690    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000997502  normal  0.0691909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12415    100 
 
 		 1916 bp  3798    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000185069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  100 
 
 		 327 bp  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  100 
 
 		 885 bp  1754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  85.22 
 
 		 837 bp  422  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2223  transposase IS3/IS911 family protein  82.76 
 
 		 270 bp  161  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.055564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2224  hypothetical protein  94.74 
 
 		 468 bp  149  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0536886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  97.62 
 
 		 327 bp  75.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2587  hypothetical protein  81.62 
 
 		 279 bp  71.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000140598  hitchhiker  0.000388749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2046  hypothetical protein  82.76 
 
 		 420 bp  71.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156175  hitchhiker  0.00448876 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5443  transposase IS3/IS911 family protein  89.66 
 
 		 327 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  82.2 
 
 		 906 bp  67.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  82.2 
 
 		 906 bp  67.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  82.2 
 
 		 906 bp  67.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  90.74 
 
 		 852 bp  67.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    90.74 
 
 		 912 bp  67.9  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  82.2 
 
 		 876 bp  67.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3221  integrase catalytic subunit  89.66 
 
 		 1128 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0559107  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4646  hypothetical protein  89.66 
 
 		 912 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  93.33 
 
 		 900 bp  65.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  93.33 
 
 		 900 bp  65.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  90.38 
 
 		 450 bp  63.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  90.38 
 
 		 906 bp  63.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  90.38 
 
 		 906 bp  63.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    90.38 
 
 		 906 bp  63.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  90.38 
 
 		 906 bp  63.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 327 bp  63.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 327 bp  63.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2045  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 270 bp  63.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00952003  normal  0.01022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0381  transposase IS3/IS911 family protein  97.22 
 
 		 321 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0742  transposase IS3/IS911 family protein  97.22 
 
 		 321 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1403  transposase IS3/IS911 family protein  97.22 
 
 		 321 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1894  transposase IS3/IS911 family protein  97.22 
 
 		 321 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310472  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4081  transposase IS3/IS911 family protein  97.22 
 
 		 321 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4236  transposase IS3/IS911 family protein  97.22 
 
 		 321 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4623  transposase IS3/IS911 family protein  97.22 
 
 		 321 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0223543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 327 bp  63.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    82.52 
 
 		 2389 bp  61.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5432  transposase IS3/IS911  87.93 
 
 		 366 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.115544 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5601  transposase IS3/IS911  87.93 
 
 		 327 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5829  transposase IS3/IS911 family protein  87.93 
 
 		 366 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.342164 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6002  transposase IS3/IS911 family protein  87.93 
 
 		 327 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000711123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 330 bp  56  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  88.46 
 
 		 906 bp  56  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  100 
 
 		 558 bp  56  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  100 
 
 		 906 bp  54  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  89.36 
 
 		 300 bp  54  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  88.24 
 
 		 906 bp  54  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  100 
 
 		 906 bp  54  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    88.24 
 
 		 2015 bp  54  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  88 
 
 		 855 bp  52  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3287  transposase IS3/IS911 family protein  92.11 
 
 		 279 bp  52  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0064    96.67 
 
 		 594 bp  52  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  88 
 
 		 855 bp  52  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  88 
 
 		 855 bp  52  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  88 
 
 		 855 bp  52  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2845    96.55 
 
 		 965 bp  50.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 		 318 bp  50.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  79.31 
 
 		 927 bp  50.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 		 318 bp  50.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    96.55 
 
 		 943 bp  50.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  82.02 
 
 		 867 bp  50.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26530  precorrin-3 methylase CobJ  96.43 
 
 		 1680 bp  48.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0702387  normal  0.593187 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 849 bp  48.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 849 bp  48.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>