192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0133 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0133  transposase subunit; putative  100 
 
 		 68 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  70.59 
 
 		 303 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  66.18 
 
 		 99 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  70 
 
 		 283 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  66.18 
 
 		 299 aa  100  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  66.18 
 
 		 299 aa  100  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  68.57 
 
 		 285 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  68.57 
 
 		 285 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  68.57 
 
 		 285 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  68.57 
 
 		 285 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  68.57 
 
 		 285 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  70.77 
 
 		 283 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  67.16 
 
 		 282 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  67.16 
 
 		 282 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  70.77 
 
 		 304 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  71.43 
 
 		 304 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  71.43 
 
 		 304 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  68.85 
 
 		 284 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  68.85 
 
 		 284 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  68.85 
 
 		 284 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  68.85 
 
 		 284 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  61.19 
 
 		 282 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  61.19 
 
 		 282 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  58.82 
 
 		 296 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  58.82 
 
 		 296 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  58.82 
 
 		 296 aa  90.5  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  58.82 
 
 		 295 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  58.82 
 
 		 295 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  58.82 
 
 		 295 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  58.82 
 
 		 295 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  58.82 
 
 		 295 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  58.82 
 
 		 295 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 295 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  62.32 
 
 		 301 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  62.32 
 
 		 301 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  63.77 
 
 		 301 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  63.77 
 
 		 301 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  57.35 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  57.35 
 
 		 295 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1390  transposase  57.35 
 
 		 82 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.185969 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  57.35 
 
 		 296 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  55.88 
 
 		 296 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  55.88 
 
 		 296 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0115  ISBt3 transposase subunit protein  62.12 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.35522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  60.87 
 
 		 244 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  55.88 
 
 		 296 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  55.88 
 
 		 296 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  60.87 
 
 		 301 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  60.87 
 
 		 301 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  57.97 
 
 		 301 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2037  transposase subunit; putative  56.92 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  60.87 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  57.97 
 
 		 301 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  57.97 
 
 		 301 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  62.71 
 
 		 301 aa  80.5  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  62.71 
 
 		 301 aa  80.5  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  69.23 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  69.23 
 
 		 301 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  69.23 
 
 		 301 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  69.23 
 
 		 301 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  67.31 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  52.17 
 
 		 291 aa  73.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  51.52 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  52.17 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  52.17 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  52.17 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0597  integrase, catalytic region  55.56 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3180  putative transposase  52.11 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3242  putative transposase  52.11 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3192  putative transposase  52.11 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  53.23 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  53.23 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  53.23 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  53.23 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  53.23 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  53.23 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  53.23 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  53.23 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  53.23 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>