139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3424 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  93.21 
 
 		 1023 bp  1459    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3424    100 
 
 		 2811 bp  5572    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212829  normal  0.19279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  92.31 
 
 		 1401 bp  1402    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  94.14 
 
 		 1293 bp  1269    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2655    97.02 
 
 		 336 bp  587  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1589    78.17 
 
 		 2527 bp  210  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3734    89.41 
 
 		 2860 bp  194  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.222012  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3888    89.41 
 
 		 2845 bp  194  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0687901  normal  0.0695799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  82.05 
 
 		 1281 bp  153  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  80.28 
 
 		 1281 bp  151  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  83.33 
 
 		 807 bp  147  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  82.43 
 
 		 1293 bp  131  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    86.23 
 
 		 2389 bp  123  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2049    86.23 
 
 		 2995 bp  123  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0144762  decreased coverage  0.00465483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3628    86.23 
 
 		 4277 bp  123  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0797695  decreased coverage  0.00230701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  82.7 
 
 		 1305 bp  113  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  83.97 
 
 		 1311 bp  111  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  82.16 
 
 		 1305 bp  105  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  82.16 
 
 		 1305 bp  105  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  98.15 
 
 		 2691 bp  99.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  84.87 
 
 		 1293 bp  93.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  84.87 
 
 		 1293 bp  93.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4366  hypothetical protein  96.36 
 
 		 216 bp  93.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  85.59 
 
 		 1275 bp  93.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  96.3 
 
 		 2577 bp  91.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  86.44 
 
 		 1428 bp  91.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0049  cellulose-binding domain-containing protein  96.15 
 
 		 2223 bp  87.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  96.15 
 
 		 4536 bp  87.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1679  hypothetical protein  94.55 
 
 		 2241 bp  85.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.548222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  94.44 
 
 		 2619 bp  83.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  94.44 
 
 		 2793 bp  83.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  84.76 
 
 		 1134 bp  81.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  84.76 
 
 		 1134 bp  81.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  84.76 
 
 		 1236 bp  81.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  95.92 
 
 		 2319 bp  81.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6626  hypothetical protein  94 
 
 		 906 bp  75.8  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  92.59 
 
 		 1425 bp  75.8  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6705  Chromosome segregation ATPase-like protein  95.45 
 
 		 1635 bp  71.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.901052  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  92.31 
 
 		 2973 bp  71.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 927 bp  71.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46542  predicted protein  100 
 
 		 3067 bp  71.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.893722  normal  0.156385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  100 
 
 		 1374 bp  71.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0323  HTTM domain protein  100 
 
 		 1050 bp  71.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  100 
 
 		 4506 bp  69.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43398  APC family transporter: amino acid  100 
 
 		 1695 bp  69.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2702  polysaccharide deacetylase  92.16 
 
 		 3918 bp  69.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  93.62 
 
 		 2268 bp  69.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  95.24 
 
 		 2715 bp  67.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  90.74 
 
 		 1056 bp  67.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 2715 bp  67.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  100 
 
 		 4662 bp  67.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5314  Putative membrane protein involved in toxin uptake  92 
 
 		 2835 bp  67.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5912  WD40 repeat, subgroup  100 
 
 		 1329 bp  65.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4594  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 1002 bp  65.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93419  predicted protein  100 
 
 		 852 bp  65.9  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0237675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2970  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 5526 bp  65.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0175  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 		 1587 bp  65.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.588065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2459  hypothetical protein  97.3 
 
 		 1833 bp  65.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.78533 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 2691 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2819  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  97.22 
 
 		 2463 bp  63.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200403  normal  0.775609 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4924  hypothetical protein  90.38 
 
 		 279 bp  63.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 2781 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  100 
 
 		 2691 bp  63.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  97.22 
 
 		 6411 bp  63.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0891  hypothetical protein  90.38 
 
 		 1059 bp  63.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  91.49 
 
 		 2565 bp  61.9  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33243  predicted protein  97.14 
 
 		 1344 bp  61.9  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6948  serine/threonine protein kinase  97.14 
 
 		 1599 bp  61.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5652  hypothetical protein  100 
 
 		 144 bp  61.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.345135  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  88.89 
 
 		 7017 bp  60  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3467  hypothetical protein  97.37 
 
 		 1206 bp  60  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.29317  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1116  putative polyketide synthase  88.89 
 
 		 6885 bp  60  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0111  hypothetical protein  88.89 
 
 		 744 bp  60  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0271  hypothetical protein  91.3 
 
 		 1854 bp  60  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4500  hypothetical protein  88.89 
 
 		 2247 bp  60  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2386  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  100 
 
 		 2040 bp  60  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3199  carbamoyl phosphate synthase small subunit  100 
 
 		 1266 bp  58  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00261776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  100 
 
 		 3495 bp  58  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  96.97 
 
 		 1380 bp  58  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24408  predicted protein  100 
 
 		 895 bp  58  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000420789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4854  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 		 2388 bp  58  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4570  hypothetical protein  100 
 
 		 993 bp  58  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 3183 bp  58  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0371  hypothetical protein  100 
 
 		 1074 bp  58  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  96.97 
 
 		 1275 bp  58  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2543  hypothetical protein  100 
 
 		 1656 bp  58  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0338  hypothetical protein  94.29 
 
 		 276 bp  54  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3288  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 819 bp  54  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  94.29 
 
 		 2313 bp  54  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3124  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein like  88.24 
 
 		 957 bp  54  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0778311  hitchhiker  0.00270751 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  94.29 
 
 		 4470 bp  54  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24979  predicted protein  94.29 
 
 		 3228 bp  54  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.42763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  100 
 
 		 1419 bp  54  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 744 bp  54  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3165  hypothetical protein  92.31 
 
 		 336 bp  54  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68581  normal  0.109372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4461  hypothetical protein  94.29 
 
 		 3174 bp  54  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.481101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1507  hypothetical protein  96.77 
 
 		 1035 bp  54  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  87.27 
 
 		 2328 bp  54  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5536  hypothetical protein  94.12 
 
 		 759 bp  52  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26186  predicted protein  100 
 
 		 677 bp  52  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.347334  normal  0.492829 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>