22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5314 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5314  Putative membrane protein involved in toxin uptake  100 
 
 		 944 aa  1573    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4461  hypothetical protein  54.8 
 
 		 1057 aa  202  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.481101  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  24.4 
 
 		 1000 aa  76.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2082  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1703 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  34.17 
 
 		 369 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  28.9 
 
 		 517 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  28.87 
 
 		 788 aa  50.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  18.35 
 
 		 5185 aa  50.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 		 264 aa  48.5  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.4 
 
 		 333 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.58 
 
 		 309 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  17.9 
 
 		 1240 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  28.83 
 
 		 268 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  38.02 
 
 		 2105 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  37.36 
 
 		 213 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  32.7 
 
 		 299 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  29.85 
 
 		 216 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  21.39 
 
 		 3521 aa  46.2  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  28.63 
 
 		 493 aa  46.2  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  36.31 
 
 		 1033 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  32.94 
 
 		 745 aa  44.7  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.15 
 
 		 1795 aa  44.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>