45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3734 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  94.37 
 
 		 1380 bp  1199    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  99.63 
 
 		 1389 bp  1586    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3888    100 
 
 		 2845 bp  2900    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0687901  normal  0.0695799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3734    100 
 
 		 2860 bp  5670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.222012  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  99.63 
 
 		 1389 bp  1586    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  99.63 
 
 		 1389 bp  1586    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3471    99.63 
 
 		 3127 bp  1586    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157183  hitchhiker  0.00172393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  95.13 
 
 		 1380 bp  1247    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    95.13 
 
 		 6126 bp  1247    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1456    100 
 
 		 375 bp  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.85037  normal  0.451915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  98.65 
 
 		 1389 bp  1522    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  99.63 
 
 		 1389 bp  1586    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0425    99.63 
 
 		 3175 bp  1586    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3424    89.41 
 
 		 2811 bp  194  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212829  normal  0.19279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1589    83.91 
 
 		 2527 bp  163  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330656  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  79.67 
 
 		 1350 bp  159  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    79.67 
 
 		 3818 bp  159  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  85.53 
 
 		 1344 bp  127  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  85.53 
 
 		 1344 bp  127  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  85.53 
 
 		 1344 bp  127  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  85.53 
 
 		 1344 bp  127  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  85.53 
 
 		 1344 bp  127  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  93.1 
 
 		 1275 bp  83.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  86.76 
 
 		 1281 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6594  transposase mutator type  86.76 
 
 		 888 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  86.76 
 
 		 1281 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6787    86.76 
 
 		 7304 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  86.76 
 
 		 1281 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  82.47 
 
 		 1251 bp  58  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  85.29 
 
 		 1278 bp  56  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  85.29 
 
 		 1278 bp  56  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  85.29 
 
 		 1278 bp  56  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  85.29 
 
 		 1278 bp  56  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  85.29 
 
 		 1278 bp  56  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  84 
 
 		 1236 bp  54  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  85.71 
 
 		 1260 bp  54  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  85.71 
 
 		 1260 bp  54  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  85.71 
 
 		 1260 bp  54  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  85.71 
 
 		 1260 bp  54  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  84 
 
 		 1236 bp  54  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  96.55 
 
 		 1251 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  96.55 
 
 		 1251 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  96.55 
 
 		 1251 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  96.55 
 
 		 1251 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3661  transposase mutator type  96.55 
 
 		 1299 bp  50.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.356207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>