86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3471 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2079  IstA2  99.88 
 
 
1605 bp  1610    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  100 
 
 
1605 bp  1618    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3471    100 
 
 
3127 bp  6199    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157183  hitchhiker  0.00172393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  100 
 
 
1389 bp  2753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  100 
 
 
1389 bp  2753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3734    99.63 
 
 
2860 bp  1586    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.222012  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  100 
 
 
1389 bp  2753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0425    99.93 
 
 
3175 bp  2997    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  100 
 
 
1389 bp  2753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  97.05 
 
 
1380 bp  2375    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    96.57 
 
 
6126 bp  2597    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  96.39 
 
 
1380 bp  2303    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1456    100 
 
 
375 bp  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.85037  normal  0.451915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  99.42 
 
 
1389 bp  2690    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  100 
 
 
1605 bp  1618    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  80.22 
 
 
1350 bp  222  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    80.22 
 
 
3818 bp  222  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  80.04 
 
 
1350 bp  214  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  85.77 
 
 
1368 bp  210  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  85.77 
 
 
1368 bp  210  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  85.77 
 
 
1368 bp  210  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    79.85 
 
 
2767 bp  206  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  79.85 
 
 
1350 bp  206  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  79.85 
 
 
1350 bp  206  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  79.66 
 
 
1350 bp  198  7e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  84.55 
 
 
1389 bp  176  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  84.55 
 
 
1389 bp  176  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  84.55 
 
 
1389 bp  176  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  84.55 
 
 
1389 bp  176  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1742    84.55 
 
 
2735 bp  176  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273316  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  83.73 
 
 
1344 bp  174  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  83.73 
 
 
1344 bp  174  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  83.73 
 
 
1344 bp  174  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  84.12 
 
 
1389 bp  168  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2591    84.12 
 
 
2288 bp  168  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  83.33 
 
 
1344 bp  167  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  83.33 
 
 
1344 bp  167  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4282    82.8 
 
 
1131 bp  155  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.921914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  86.23 
 
 
1356 bp  123  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  86.23 
 
 
1356 bp  123  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  81.05 
 
 
1671 bp  91.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  81.05 
 
 
1620 bp  91.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  81.05 
 
 
1668 bp  91.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4944  hypothetical protein  100 
 
 
132 bp  87.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  93.1 
 
 
1275 bp  83.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  86.42 
 
 
1695 bp  73.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  86.76 
 
 
1281 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  86.76 
 
 
1281 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6787    86.76 
 
 
7304 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5159  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6594  transposase mutator type  86.76 
 
 
888 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771123  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  86.76 
 
 
1281 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  92.68 
 
 
1236 bp  58  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  82.47 
 
 
1251 bp  58  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1740    90.91 
 
 
1077 bp  56  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0731895  normal  0.031178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  85.29 
 
 
1278 bp  56  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  85.29 
 
 
1278 bp  56  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  85.29 
 
 
1278 bp  56  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  85.29 
 
 
1278 bp  56  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  85.29 
 
 
1278 bp  56  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  90.91 
 
 
1227 bp  56  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  90.91 
 
 
1227 bp  56  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1227    90.91 
 
 
1208 bp  56  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  84 
 
 
1236 bp  54  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  84 
 
 
1236 bp  54  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2347  transposase mutator family protein  90.24 
 
 
549 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.796626  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3661  transposase mutator type  96.55 
 
 
1299 bp  50.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.356207  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0270  putative transposase  90.24 
 
 
489 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  90.24 
 
 
1269 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  90.24 
 
 
1833 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0625  transposase mutator family protein  90.24 
 
 
873 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  90.24 
 
 
1269 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1528  transposase mutator family protein  90.24 
 
 
1269 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163505  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1785  transposase mutator family protein  90.24 
 
 
186 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.717249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0505  transposase  90.24 
 
 
1920 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.804069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1744  transposase mutator family protein  90.24 
 
 
681 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1353 bp  50.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2348  transposase mutator family protein  90.24 
 
 
1269 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  90.24 
 
 
1269 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  90.24 
 
 
1269 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3244  transposase mutator family protein  90.24 
 
 
1269 bp  50.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625679  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  96.55 
 
 
1251 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  96.55 
 
 
1251 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  87.76 
 
 
1677 bp  50.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  96.55 
 
 
1251 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  96.55 
 
 
1251 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  96.55 
 
 
813 bp  50.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>