65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4282 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008766  Ajs_4282    100 
 
 
1131 bp  2242    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.921914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  80.3 
 
 
1344 bp  295  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  80.16 
 
 
1344 bp  287  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  80.16 
 
 
1344 bp  287  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  80.16 
 
 
1344 bp  287  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  80.16 
 
 
1344 bp  287  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  89.45 
 
 
1368 bp  228  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  89.45 
 
 
1368 bp  228  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  89.45 
 
 
1368 bp  228  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  79.9 
 
 
1350 bp  220  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  79.9 
 
 
1350 bp  220  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    79.9 
 
 
2767 bp  220  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  79.9 
 
 
1350 bp  220  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  79.9 
 
 
1350 bp  220  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    79.9 
 
 
3818 bp  220  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  79.74 
 
 
1350 bp  212  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  89.08 
 
 
1356 bp  194  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  89.08 
 
 
1356 bp  194  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  82.8 
 
 
1389 bp  155  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3471    82.8 
 
 
3127 bp  155  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157183  hitchhiker  0.00172393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  82.8 
 
 
1389 bp  155  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  82.8 
 
 
1380 bp  155  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    82.8 
 
 
6126 bp  155  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  82.8 
 
 
1380 bp  155  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  82.8 
 
 
1389 bp  155  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  82.8 
 
 
1389 bp  155  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0425    82.8 
 
 
3175 bp  155  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  82.8 
 
 
1389 bp  155  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  81 
 
 
1389 bp  153  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  81 
 
 
1389 bp  153  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  81 
 
 
1389 bp  153  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1742    81 
 
 
2735 bp  153  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  81 
 
 
1389 bp  153  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2591    81 
 
 
2288 bp  153  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  81 
 
 
1389 bp  153  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  92.86 
 
 
1275 bp  79.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  89.8 
 
 
1236 bp  58  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3661  transposase mutator type  89.58 
 
 
1299 bp  56  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.356207  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6594  transposase mutator type  85.29 
 
 
888 bp  56  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771123  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  85.29 
 
 
1281 bp  56  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  85.29 
 
 
1281 bp  56  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6787    85.29 
 
 
7304 bp  56  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5159  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  85.29 
 
 
1281 bp  56  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2732    88.46 
 
 
375 bp  56  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.131847  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0254    84.62 
 
 
2624 bp  50.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4694    90.24 
 
 
186 bp  50.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.904495  hitchhiker  0.000326408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1744  transposase mutator family protein  87.5 
 
 
681 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3244  transposase mutator family protein  87.5 
 
 
1269 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0505  transposase  87.5 
 
 
1920 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.804069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1785  transposase mutator family protein  87.5 
 
 
186 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.717249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1528  transposase mutator family protein  87.5 
 
 
1269 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163505  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  87.5 
 
 
1269 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0625  transposase mutator family protein  87.5 
 
 
873 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  87.5 
 
 
1833 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  87.5 
 
 
1269 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0270  putative transposase  87.5 
 
 
489 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2347  transposase mutator family protein  87.5 
 
 
549 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.796626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2348  transposase mutator family protein  87.5 
 
 
1269 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  87.5 
 
 
1269 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  87.5 
 
 
1269 bp  48.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  83.82 
 
 
1278 bp  48.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  83.82 
 
 
1278 bp  48.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  83.82 
 
 
1278 bp  48.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  83.82 
 
 
1278 bp  48.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  83.82 
 
 
1278 bp  48.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>