42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1742 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  100 
 
 		 1389 bp  2753    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  99.86 
 
 		 1389 bp  2736    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2591    99.8 
 
 		 2288 bp  2968    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  100 
 
 		 1389 bp  2753    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1742    100 
 
 		 2735 bp  5422    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  100 
 
 		 1389 bp  2753    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  100 
 
 		 1389 bp  2753    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0371  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 		 1221 bp  1966    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  78.17 
 
 		 1356 bp  210  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  78.17 
 
 		 1356 bp  210  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  84.55 
 
 		 1380 bp  176  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  84.55 
 
 		 1389 bp  176  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  84.55 
 
 		 1389 bp  176  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  84.55 
 
 		 1389 bp  176  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3471    84.55 
 
 		 3127 bp  176  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157183  hitchhiker  0.00172393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    84.55 
 
 		 6126 bp  176  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  84.55 
 
 		 1380 bp  176  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  84.55 
 
 		 1389 bp  176  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  84.55 
 
 		 1389 bp  176  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0425    84.55 
 
 		 3175 bp  176  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  83.91 
 
 		 1368 bp  163  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  83.91 
 
 		 1368 bp  163  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  83.91 
 
 		 1368 bp  163  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4282    81 
 
 		 1131 bp  153  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.921914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  81.51 
 
 		 1344 bp  123  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  81.51 
 
 		 1344 bp  123  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  81.51 
 
 		 1344 bp  123  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  81.51 
 
 		 1344 bp  123  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  81.51 
 
 		 1344 bp  123  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  80 
 
 		 1350 bp  95.6  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  80 
 
 		 1350 bp  95.6  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    80 
 
 		 3818 bp  95.6  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  80 
 
 		 1350 bp  95.6  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  80 
 
 		 1350 bp  95.6  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    80 
 
 		 2767 bp  95.6  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  80 
 
 		 1350 bp  95.6  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  85.48 
 
 		 1278 bp  52  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  85.48 
 
 		 1278 bp  52  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  85.48 
 
 		 1278 bp  52  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  85.48 
 
 		 1278 bp  52  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  85.48 
 
 		 1278 bp  52  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1625  hypothetical protein  100 
 
 		 774 bp  50.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.717733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>