More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0371 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0371  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 
406 aa  821    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13832  transposase  41.01 
 
 
444 aa  294  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0610041  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11340  transposase  40.78 
 
 
444 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0604712  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0556  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.86 
 
 
420 aa  289  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2780  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.86 
 
 
420 aa  289  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0010  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.22 
 
 
420 aa  288  9e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00450  transposase  42.52 
 
 
420 aa  285  8e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10230  transposase  42.52 
 
 
420 aa  285  8e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03140  transposase  42.52 
 
 
420 aa  285  8e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04670  transposase  42.52 
 
 
420 aa  285  8e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04880  transposase  42.52 
 
 
420 aa  285  8e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14300  transposase  42.52 
 
 
420 aa  285  8e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381187  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4095  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.77 
 
 
433 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.131916  normal  0.0139853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1436  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.47 
 
 
433 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172417  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5327  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.47 
 
 
433 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5385  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.21 
 
 
433 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14350  transposase  42.86 
 
 
350 aa  256  7e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8543  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.73 
 
 
425 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  hitchhiker  0.0000144931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1766  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.86 
 
 
432 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.785339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2515  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.86 
 
 
432 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.785339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2875  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.86 
 
 
432 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3434  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.86 
 
 
432 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.823644  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4012  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.86 
 
 
432 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.653863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1834  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.12 
 
 
432 aa  215  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0315  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.89 
 
 
432 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677908  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3476  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.12 
 
 
431 aa  212  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418883  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2896  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.96 
 
 
390 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1271  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.96 
 
 
390 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.96 
 
 
390 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.96 
 
 
389 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0526  putative transposase  30.2 
 
 
406 aa  149  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1788  transposase and inactivated derivatives  29.49 
 
 
411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1174  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.95 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000815795  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0599  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.95 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1177  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.95 
 
 
408 aa  140  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123826  normal  0.601968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.95 
 
 
408 aa  140  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.520122  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.95 
 
 
408 aa  140  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.95 
 
 
408 aa  140  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0551  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.95 
 
 
408 aa  140  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.340213  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.11 
 
 
408 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.468712  normal  0.0451791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0341  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.85 
 
 
408 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.717183  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0081  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.34 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0229  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.34 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.013108  unclonable  1.0640799999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0900  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.34 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1002  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.34 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.692559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1333  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.34 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.38515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1398  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.34 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.488423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1978  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.34 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00748461  normal  0.0175211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2160  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.34 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00641711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2484  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.34 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.23891  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3003  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.34 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3481  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  26.34 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0373  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.23 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384224  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0936  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.23 
 
 
411 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0006  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.23 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1165  transposase  28.21 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1949  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.96 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.960551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.75 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.73 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.79 
 
 
417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2843  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.16 
 
 
417 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2172  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.72 
 
 
407 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1105  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.16 
 
 
417 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0847  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.16 
 
 
417 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0520  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.16 
 
 
417 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.93 
 
 
421 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0228  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  25.95 
 
 
402 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0665  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  25.95 
 
 
402 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.180609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1444  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.17 
 
 
407 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.551686  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0658  transposase  26.76 
 
 
411 aa  123  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0748  transposase  26.76 
 
 
411 aa  123  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0642968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1580  transposase  26.76 
 
 
411 aa  123  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000196779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1922  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.28 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.180002 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0708  transposase  26.99 
 
 
411 aa  119  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0788  transposase  26.99 
 
 
411 aa  119  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2352  transposase ISL3 family protein  30.69 
 
 
440 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0086  transposase  26.99 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0202  transposase  26.99 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0597  transposase  26.99 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.600179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0765  transposase  26.99 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0832  transposase  26.99 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.108641  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1063  transposase  26.99 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1507  transposase  26.99 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.667036  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1918  transposase  26.99 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1981  transposase  26.99 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2342  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.25 
 
 
417 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712759  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0487  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.25 
 
 
417 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2456  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.25 
 
 
417 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.352628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0797  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.25 
 
 
417 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3253  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.25 
 
 
417 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3487  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.25 
 
 
417 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.25 
 
 
417 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0736  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.23 
 
 
431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1244  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.77 
 
 
361 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.661907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1951  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.09 
 
 
401 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.927726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3755  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.09 
 
 
401 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2515  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  24.8 
 
 
407 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.957885  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2840  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  24.8 
 
 
407 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000161763  hitchhiker  3.30659e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3102  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  24.8 
 
 
407 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3396  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  24.8 
 
 
407 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.838186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>