77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24210 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22340  transposase  99.93 
 
 		 1350 bp  2668    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  100 
 
 		 1350 bp  2676    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  100 
 
 		 1356 bp  2252    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  99.78 
 
 		 1350 bp  2652    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    99.79 
 
 		 3818 bp  2835    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  81.52 
 
 		 1344 bp  666    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  99.85 
 
 		 1350 bp  2660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  81.67 
 
 		 1344 bp  652    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  81.74 
 
 		 1344 bp  690    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  81.75 
 
 		 1344 bp  660    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  99.65 
 
 		 1317 bp  2220    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  81.83 
 
 		 1344 bp  668    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    100 
 
 		 2767 bp  5485    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  100 
 
 		 1350 bp  2676    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  82.52 
 
 		 1317 bp  668    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  82.52 
 
 		 1317 bp  668    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  79.73 
 
 		 1317 bp  305  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  79.73 
 
 		 1317 bp  305  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  79.01 
 
 		 1137 bp  270  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0230    78.51 
 
 		 1328 bp  228  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0928078  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4282    79.9 
 
 		 1131 bp  220  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.921914 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  79.39 
 
 		 1308 bp  218  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  79.39 
 
 		 936 bp  218  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  79.39 
 
 		 1308 bp  218  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  83.33 
 
 		 1353 bp  210  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  83.33 
 
 		 1353 bp  210  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  80.08 
 
 		 1329 bp  210  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  79.85 
 
 		 1389 bp  206  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3471    79.85 
 
 		 3127 bp  206  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157183  hitchhiker  0.00172393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  79.85 
 
 		 1389 bp  206  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  79.85 
 
 		 1389 bp  206  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  79.85 
 
 		 1389 bp  206  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  79.85 
 
 		 1389 bp  206  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0425    79.85 
 
 		 3175 bp  206  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  79.42 
 
 		 1317 bp  200  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  79.42 
 
 		 1317 bp  200  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00920    79.92 
 
 		 1261 bp  196  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07920    79.92 
 
 		 1267 bp  196  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05340    79.92 
 
 		 1267 bp  196  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  79.48 
 
 		 1380 bp  190  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  79.48 
 
 		 1380 bp  190  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    79.48 
 
 		 6126 bp  190  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  80.94 
 
 		 1311 bp  190  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05280    79.73 
 
 		 1297 bp  188  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  80.23 
 
 		 1308 bp  184  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  80.23 
 
 		 1308 bp  184  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  80.23 
 
 		 1308 bp  184  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17100    80.23 
 
 		 2292 bp  184  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0207297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  80.23 
 
 		 1308 bp  184  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  80.23 
 
 		 1308 bp  184  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  81.18 
 
 		 1308 bp  176  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  81.18 
 
 		 1308 bp  176  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  86.67 
 
 		 1041 bp  167  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  86.67 
 
 		 1332 bp  167  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  86.11 
 
 		 1332 bp  159  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  85.93 
 
 		 1368 bp  157  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  85.93 
 
 		 1368 bp  157  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  85.93 
 
 		 1368 bp  157  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  85.86 
 
 		 1356 bp  155  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  85.86 
 
 		 1356 bp  155  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  83.33 
 
 		 1089 bp  143  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3284    93.98 
 
 		 249 bp  125  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  80 
 
 		 1389 bp  95.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  80 
 
 		 1389 bp  95.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  80 
 
 		 1389 bp  95.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2591    80 
 
 		 2288 bp  95.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1742    80 
 
 		 2735 bp  95.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  80 
 
 		 1389 bp  95.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  80 
 
 		 1389 bp  95.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22440  transposase family protein  83.62 
 
 		 1311 bp  79.8  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0283397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06900  transposase family protein  83.62 
 
 		 1311 bp  79.8  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0445695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02650    84.47 
 
 		 123 bp  77.8  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2570    87.32 
 
 		 538 bp  69.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.45845  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0990  transposase  91.67 
 
 		 534 bp  63.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20600    86.57 
 
 		 243 bp  61.9  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  86.15 
 
 		 1275 bp  58  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3661  transposase mutator type  94.12 
 
 		 1299 bp  52  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.356207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>