39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4694 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4694    100 
 
 
186 bp  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.904495  hitchhiker  0.000326408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  94.97 
 
 
1281 bp  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  94.97 
 
 
1281 bp  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6787    94.97 
 
 
7304 bp  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5159  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  94.97 
 
 
1281 bp  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6594  transposase mutator type  94.97 
 
 
888 bp  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771123  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2891  isrso7-transposase  91.3 
 
 
627 bp  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1119  ISRSO7-transposase protein  90.22 
 
 
627 bp  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.981244  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2739  isrso7-transposase  90.22 
 
 
627 bp  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  89.17 
 
 
1278 bp  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  88.54 
 
 
1278 bp  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  88.54 
 
 
1278 bp  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  88.54 
 
 
1278 bp  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  91.27 
 
 
1248 bp  163  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  87.9 
 
 
1278 bp  161  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  87.65 
 
 
1260 bp  81.8  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  87.65 
 
 
1260 bp  81.8  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  87.65 
 
 
1260 bp  81.8  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  87.65 
 
 
1260 bp  81.8  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  85.71 
 
 
1236 bp  60  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  85.71 
 
 
1236 bp  60  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  92.31 
 
 
1251 bp  54  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  92.31 
 
 
1251 bp  54  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  92.31 
 
 
1251 bp  54  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  92.31 
 
 
1251 bp  54  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4282    90.24 
 
 
1131 bp  50.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.921914 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  83.56 
 
 
1236 bp  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  88.64 
 
 
1389 bp  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3734    88.64 
 
 
2860 bp  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.222012  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  88.64 
 
 
1389 bp  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  88.64 
 
 
1389 bp  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3471    88.64 
 
 
3127 bp  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157183  hitchhiker  0.00172393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  88.64 
 
 
1380 bp  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    88.64 
 
 
6126 bp  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  88.64 
 
 
1380 bp  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  88.64 
 
 
1389 bp  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  88.64 
 
 
1389 bp  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0425    88.64 
 
 
3175 bp  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  96.3 
 
 
675 bp  46.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>