14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1456 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0425    100 
 
 		 3175 bp  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  100 
 
 		 1389 bp  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1456    100 
 
 		 375 bp  743    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.85037  normal  0.451915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3471    100 
 
 		 3127 bp  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157183  hitchhiker  0.00172393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  100 
 
 		 1389 bp  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  100 
 
 		 1389 bp  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3734    100 
 
 		 2860 bp  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.222012  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  100 
 
 		 1389 bp  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  98.23 
 
 		 1389 bp  624  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  89.14 
 
 		 1380 bp  341  9e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    89.14 
 
 		 6126 bp  341  9e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  89.14 
 
 		 1380 bp  341  9e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  84.29 
 
 		 1356 bp  52  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  84.29 
 
 		 1356 bp  52  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>