162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1740 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  98.7 
 
 
1227 bp  2022    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  98.7 
 
 
1227 bp  2022    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1227    99.91 
 
 
1208 bp  2125    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1740    100 
 
 
1077 bp  2135    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0731895  normal  0.031178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  97.48 
 
 
1227 bp  1911    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  99.35 
 
 
1227 bp  2077    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  97.48 
 
 
1227 bp  1911    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  97.39 
 
 
1227 bp  1903    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  97.48 
 
 
1227 bp  1911    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  81.96 
 
 
1227 bp  551  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  81.96 
 
 
1227 bp  551  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00238  transposase, Mutator family  82.44 
 
 
786 bp  450  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1268    78.51 
 
 
1225 bp  278  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0611207  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5649    92.9 
 
 
309 bp  220  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2550a    83.41 
 
 
855 bp  149  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2299    81.4 
 
 
512 bp  87.7  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0127428 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  91.23 
 
 
1212 bp  73.8  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  95.56 
 
 
1275 bp  73.8  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0166    91.07 
 
 
243 bp  71.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  95.45 
 
 
1251 bp  71.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  93.48 
 
 
870 bp  67.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03988  IS1113 transposase  91.84 
 
 
996 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01962  IS1113 transposase  91.84 
 
 
996 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00540363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00428  IS1113 transposase  91.84 
 
 
996 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00290  transposase  91.84 
 
 
294 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0508565  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00578  IS1113 transposase  91.84 
 
 
996 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00515  IS1113 tranposase  91.84 
 
 
996 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0127136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01463  IS1113 transposase  91.84 
 
 
996 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  81.2 
 
 
1251 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06261  IS1113 transposase  91.84 
 
 
996 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.190082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05637  IS1113 transposase  91.84 
 
 
996 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03663  IS1113 transposase  91.84 
 
 
996 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03164  IS1113 transposase  91.84 
 
 
996 bp  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.800194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  87.5 
 
 
1260 bp  63.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  87.5 
 
 
1260 bp  63.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  87.5 
 
 
1260 bp  63.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  87.5 
 
 
1260 bp  63.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4726  transposase mutator type  89.29 
 
 
1260 bp  63.9  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685507  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4789  transposase mutator type  89.29 
 
 
1260 bp  63.9  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4807  transposase mutator type  89.29 
 
 
1260 bp  63.9  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370083  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5742  transposase mutator type  89.29 
 
 
1260 bp  63.9  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2542    84.81 
 
 
486 bp  61.9  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183438  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  82.52 
 
 
1236 bp  61.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2905  transposase mutator type  88.14 
 
 
1308 bp  61.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.482411  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  86.36 
 
 
1224 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1379  transposase, mutator type  86.36 
 
 
1101 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1691    86.36 
 
 
1225 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0391354  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  86.36 
 
 
1224 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6034  transposase mutator type  87.93 
 
 
1203 bp  60  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0363265  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6091    87.93 
 
 
1196 bp  60  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  86.89 
 
 
1251 bp  58  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  94.59 
 
 
1368 bp  58  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  94.59 
 
 
1368 bp  58  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  94.59 
 
 
1368 bp  58  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1793  transposase mutator type  87.5 
 
 
1260 bp  56  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  90.91 
 
 
1344 bp  56  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  90.91 
 
 
1344 bp  56  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2047    90.91 
 
 
6126 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.231348  decreased coverage  0.00652889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  90.91 
 
 
1380 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0356  transposase mutator type  87.5 
 
 
1260 bp  56  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0909  transposase mutator type  87.5 
 
 
1260 bp  56  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2936  transposase mutator type  87.5 
 
 
1260 bp  56  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  88.46 
 
 
1221 bp  56  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  90.91 
 
 
1344 bp  56  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  90.91 
 
 
1344 bp  56  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  90.91 
 
 
1344 bp  56  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  90.91 
 
 
1389 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0425    90.91 
 
 
3175 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  90.91 
 
 
1389 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  90.91 
 
 
1380 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  90.91 
 
 
1389 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3471    90.91 
 
 
3127 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157183  hitchhiker  0.00172393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  90.91 
 
 
1389 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  90.91 
 
 
1389 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1787  transposase mutator type  87.5 
 
 
1260 bp  56  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452427 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  89.36 
 
 
1281 bp  54  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1778  transposase  85.71 
 
 
573 bp  54  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0428813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  94.29 
 
 
1260 bp  54  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0431  transposase mutator family protein  94.29 
 
 
1260 bp  54  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0926  transposase mutator family protein  94.29 
 
 
1260 bp  54  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1103  transposase mutator family protein  94.29 
 
 
1260 bp  54  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109528  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0379    94.29 
 
 
844 bp  54  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  87.27 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>