106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2550a on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2550a    100 
 
 
855 bp  1695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1740    83.41 
 
 
1077 bp  149  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0731895  normal  0.031178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  82.96 
 
 
1227 bp  141  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1227    82.96 
 
 
1208 bp  141  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  82.96 
 
 
1227 bp  141  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  82.06 
 
 
1227 bp  125  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  82.06 
 
 
1227 bp  125  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  82.06 
 
 
1227 bp  125  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  82.06 
 
 
1227 bp  125  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  82.06 
 
 
1227 bp  125  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00238  transposase, Mutator family  81.9 
 
 
786 bp  121  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4726  transposase mutator type  87.36 
 
 
1260 bp  85.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685507  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4789  transposase mutator type  87.36 
 
 
1260 bp  85.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4807  transposase mutator type  87.36 
 
 
1260 bp  85.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370083  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5742  transposase mutator type  87.36 
 
 
1260 bp  85.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1787  transposase mutator type  83.21 
 
 
1260 bp  85.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0066  hypothetical protein  100 
 
 
1098 bp  79.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  89.71 
 
 
1227 bp  79.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  89.71 
 
 
1227 bp  79.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1268    81.29 
 
 
1225 bp  77.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0611207  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5449  transposase, mutator type  82.44 
 
 
723 bp  77.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51248  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0909  transposase mutator type  86.21 
 
 
1260 bp  77.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1793  transposase mutator type  82.44 
 
 
1260 bp  77.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0356  transposase mutator type  85.06 
 
 
1260 bp  69.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2936  transposase mutator type  85.06 
 
 
1260 bp  69.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  86.67 
 
 
1248 bp  69.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  86.67 
 
 
1281 bp  69.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6787    86.67 
 
 
7304 bp  69.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5159  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  86.67 
 
 
1281 bp  69.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  86.67 
 
 
1281 bp  69.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3186    97.37 
 
 
1161 bp  67.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0379    84.88 
 
 
844 bp  67.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  83.51 
 
 
1269 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  83.51 
 
 
1833 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0625  transposase mutator family protein  83.51 
 
 
873 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  83.51 
 
 
1269 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1528  transposase mutator family protein  83.51 
 
 
1269 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0505  transposase  83.51 
 
 
1920 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.804069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1744  transposase mutator family protein  83.51 
 
 
681 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2348  transposase mutator family protein  83.51 
 
 
1269 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  83.51 
 
 
1269 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  83.51 
 
 
1269 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3244  transposase mutator family protein  83.51 
 
 
1269 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625679  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  90.57 
 
 
1209 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4788    90.57 
 
 
264 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.494188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  86.96 
 
 
1278 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  86.96 
 
 
1278 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  86.96 
 
 
1278 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  86.96 
 
 
1278 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  86.96 
 
 
1278 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6594  transposase mutator type  85.33 
 
 
888 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771123  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  85.14 
 
 
1251 bp  60  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  85.14 
 
 
1251 bp  60  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  85.14 
 
 
1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0431  transposase mutator family protein  85.14 
 
 
1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0926  transposase mutator family protein  85.14 
 
 
1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1103  transposase mutator family protein  85.14 
 
 
1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2748  transposase mutator family protein  85.14 
 
 
1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3131  transposase mutator family protein  85.14 
 
 
1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3279  transposase mutator family protein  85.14 
 
 
1191 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  83.15 
 
 
1251 bp  58  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  83.15 
 
 
1251 bp  58  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  83.15 
 
 
1251 bp  58  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  83.15 
 
 
1251 bp  58  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  83.15 
 
 
1251 bp  58  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  83.15 
 
 
1251 bp  58  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  83.15 
 
 
1251 bp  58  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1811    88.68 
 
 
348 bp  58  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678865  hitchhiker  0.00000105926 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  83.15 
 
 
1251 bp  58  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  83.15 
 
 
1251 bp  58  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0254    83.15 
 
 
2624 bp  58  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  83.15 
 
 
1251 bp  58  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  83.15 
 
 
1251 bp  58  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  83.75 
 
 
1236 bp  56  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  83.75 
 
 
1236 bp  56  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0912  transposase protein  83.75 
 
 
138 bp  56  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  96.88 
 
 
870 bp  56  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  92.31 
 
 
1212 bp  54  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2349  transposase mutator family protein  83.54 
 
 
759 bp  54  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  83.54 
 
 
1236 bp  54  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2905  transposase mutator type  92.31 
 
 
1308 bp  54  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.482411  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0166    92.11 
 
 
243 bp  52  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  84.85 
 
 
1260 bp  52  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  84.85 
 
 
1260 bp  52  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  84.85 
 
 
1260 bp  52  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  84.85 
 
 
1260 bp  52  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  89.13 
 
 
1275 bp  52  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  82.56 
 
 
1215 bp  52  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  82.56 
 
 
1215 bp  52  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  82.56 
 
 
1215 bp  52  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  87.04 
 
 
1251 bp  52  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4583    85.48 
 
 
291 bp  52  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1448    85.48 
 
 
858 bp  52  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  83.12 
 
 
1251 bp  50.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  83.12 
 
 
1251 bp  50.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  83.12 
 
 
1251 bp  50.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  83.12 
 
 
1251 bp  50.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0951    90.24 
 
 
198 bp  50.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00450587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2213    86.79 
 
 
660 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0198469  normal  0.15875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2433  transposase mutator type  86.79 
 
 
1227 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>