60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4788 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4788    100 
 
 		 264 bp  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494188 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  96 
 
 		 1209 bp  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  89.2 
 
 		 870 bp  240  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1811    96.19 
 
 		 348 bp  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678865  hitchhiker  0.00000105926 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3186    80.71 
 
 		 1161 bp  89.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1109    87.21 
 
 		 543 bp  83.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0714  hypothetical protein  97.67 
 
 		 186 bp  77.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3168    86.05 
 
 		 792 bp  75.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0186296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2179    79.4 
 
 		 1199 bp  69.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  79.4 
 
 		 1209 bp  69.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  79.4 
 
 		 1209 bp  69.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  79.4 
 
 		 1209 bp  69.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  79.4 
 
 		 1209 bp  69.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2292  transposase mutator type  79.4 
 
 		 861 bp  69.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  79.4 
 
 		 1209 bp  69.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  79.4 
 
 		 1209 bp  69.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2495    79.4 
 
 		 1155 bp  69.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.186831  hitchhiker  0.00000352345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  79.4 
 
 		 1209 bp  69.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2073    79.4 
 
 		 1199 bp  69.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000839845  hitchhiker  0.0000707086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2550a    90.57 
 
 		 855 bp  65.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2436    85.33 
 
 		 1208 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.636852  normal  0.0176396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  85.33 
 
 		 1209 bp  61.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  88.89 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  88.89 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  88.89 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  88.89 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  85.71 
 
 		 1209 bp  48.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>