95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2179 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2436    88.43 
 
 		 1208 bp  1275    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.636852  normal  0.0176396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2495    88.4 
 
 		 1155 bp  1213    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.186831  hitchhiker  0.00000352345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  88.43 
 
 		 1209 bp  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  88.43 
 
 		 1209 bp  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  88.43 
 
 		 1209 bp  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  88.43 
 
 		 1209 bp  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  88.6 
 
 		 1209 bp  1298    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2291  transposase  100 
 
 		 339 bp  672    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0059921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2292  transposase mutator type  99.77 
 
 		 861 bp  1691    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3186    82.27 
 
 		 1161 bp  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  82.63 
 
 		 1209 bp  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  82.63 
 
 		 1209 bp  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  82.63 
 
 		 1209 bp  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  82.63 
 
 		 1209 bp  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  88.43 
 
 		 1209 bp  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2179    100 
 
 		 1199 bp  2377    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  88.43 
 
 		 1209 bp  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  88.43 
 
 		 1209 bp  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  88.43 
 
 		 1209 bp  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  88.43 
 
 		 1209 bp  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  88.43 
 
 		 1209 bp  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  88.43 
 
 		 1209 bp  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2073    99.92 
 
 		 1199 bp  2369    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000839845  hitchhiker  0.0000707086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  88.51 
 
 		 1209 bp  1291    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2068    84.7 
 
 		 858 bp  609  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2015    84.7 
 
 		 858 bp  609  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.005715 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1448    84.45 
 
 		 858 bp  593  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0066    95.93 
 
 		 1031 bp  448  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0952    84.84 
 
 		 507 bp  381  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000944257  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4584    83.94 
 
 		 534 bp  349  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4669    83.94 
 
 		 534 bp  349  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1807  transposase  98.76 
 
 		 192 bp  303  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473053  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1258  transposase, Mutator family  81.45 
 
 		 678 bp  276  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2496  transposase  97.79 
 
 		 150 bp  246  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  hitchhiker  0.0000545248 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3168    83.1 
 
 		 792 bp  228  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0186296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0951    86.91 
 
 		 198 bp  180  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00450587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4667    88.1 
 
 		 180 bp  174  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.240506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2007    83.67 
 
 		 282 bp  172  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  80.59 
 
 		 1209 bp  165  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4583    88.81 
 
 		 291 bp  147  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  79.84 
 
 		 870 bp  143  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4668    88.06 
 
 		 291 bp  139  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.753237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2752    79.17 
 
 		 501 bp  119  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4582    84.35 
 
 		 150 bp  109  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2067    86.79 
 
 		 147 bp  99.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.843417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2014    86.79 
 
 		 147 bp  99.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562943 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0088  transposase  92.65 
 
 		 168 bp  95.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.310139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1449    89.16 
 
 		 147 bp  93.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.885432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1109    80.95 
 
 		 543 bp  89.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1810    85.05 
 
 		 258 bp  85.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581958  hitchhiker  0.00000102188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1450    84.48 
 
 		 132 bp  79.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632019  normal  0.893196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1811    80.89 
 
 		 348 bp  73.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678865  hitchhiker  0.00000105926 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4059  hypothetical protein  84.04 
 
 		 114 bp  71.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.829682  normal  0.700029 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3988  hypothetical protein  84.04 
 
 		 162 bp  71.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4788    79.4 
 
 		 264 bp  69.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4398  transposase mutator type  94.74 
 
 		 1203 bp  60  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4677  transposase mutator type  94.74 
 
 		 1203 bp  60  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3078  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1203 bp  60  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1531    86.15 
 
 		 1070 bp  58  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000695474 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0714  hypothetical protein  87.5 
 
 		 186 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1227 bp  54  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1227 bp  54  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1227 bp  54  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  89.36 
 
 		 1227 bp  54  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  89.36 
 
 		 1227 bp  54  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1564  transposase  88 
 
 		 129 bp  52  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0141  transposase, mutator type  86.79 
 
 		 801 bp  50.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>