70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4668 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4668    100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.753237  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4583    99.31 
 
 
291 bp  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0951    95.74 
 
 
198 bp  232  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00450587  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1448    93.62 
 
 
858 bp  208  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2007    92 
 
 
282 bp  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2068    92.91 
 
 
858 bp  200  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1258  transposase, Mutator family  91.33 
 
 
678 bp  198  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2015    92.7 
 
 
858 bp  192  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.005715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2014    98.92 
 
 
147 bp  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00562943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2067    98.92 
 
 
147 bp  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.843417  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1449    97.85 
 
 
147 bp  168  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.885432 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2292  transposase mutator type  88.06 
 
 
861 bp  139  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2073    88.06 
 
 
1199 bp  139  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000839845  hitchhiker  0.0000707086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2179    88.06 
 
 
1199 bp  139  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  87.02 
 
 
1209 bp  125  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2495    87.02 
 
 
1155 bp  125  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.186831  hitchhiker  0.00000352345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  87.02 
 
 
1209 bp  125  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  87.02 
 
 
1209 bp  125  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  87.02 
 
 
1209 bp  125  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  87.02 
 
 
1209 bp  125  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  87.02 
 
 
1209 bp  125  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  87.02 
 
 
1209 bp  125  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  86.26 
 
 
1209 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2436    86.26 
 
 
1208 bp  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.636852  normal  0.0176396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  84.33 
 
 
1209 bp  99.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  84.33 
 
 
1209 bp  99.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  84.33 
 
 
1209 bp  99.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  84.33 
 
 
1209 bp  99.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3186    86.02 
 
 
1161 bp  81.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2291  transposase  86.75 
 
 
339 bp  77.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0059921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1109    82.4 
 
 
543 bp  73.8  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3168    81.6 
 
 
792 bp  65.9  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0186296  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0066    88.33 
 
 
1031 bp  63.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  81.15 
 
 
1209 bp  60  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5449  transposase, mutator type  85.94 
 
 
723 bp  56  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51248  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0356  transposase mutator type  83.82 
 
 
1260 bp  48.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2936  transposase mutator type  83.82 
 
 
1260 bp  48.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>