More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2291 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2291  transposase  100 
 
 		 112 aa  232  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0059921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  92.86 
 
 		 402 aa  223  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  92.86 
 
 		 402 aa  223  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  92.86 
 
 		 402 aa  223  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  92.86 
 
 		 402 aa  223  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  88.39 
 
 		 402 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  88.39 
 
 		 402 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  88.39 
 
 		 402 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  88.39 
 
 		 402 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1258  transposase, Mutator family  82.14 
 
 		 225 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  69.37 
 
 		 402 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  69.37 
 
 		 289 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0957  transposase, mutator type  63.64 
 
 		 259 aa  151  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209569  unclonable  0.0000397615 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0930  transposase, mutator type  61.82 
 
 		 259 aa  147  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385661  hitchhiker  0.00180839 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1364  transposase, mutator type  62.73 
 
 		 268 aa  147  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.29614 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0885  transposase mutator family protein  61.82 
 
 		 404 aa  147  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.767788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1983  transposase mutator family protein  61.82 
 
 		 404 aa  147  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  54.13 
 
 		 403 aa  140  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  61.32 
 
 		 402 aa  140  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  49.54 
 
 		 408 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  49.54 
 
 		 408 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  49.54 
 
 		 408 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  49.54 
 
 		 408 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  49.54 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  49.54 
 
 		 408 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  49.54 
 
 		 408 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  47.75 
 
 		 404 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  47.75 
 
 		 404 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  47.75 
 
 		 404 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1218  transposase, mutator type  45.37 
 
 		 411 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  48.65 
 
 		 404 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  48.65 
 
 		 404 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  48.65 
 
 		 404 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  48.65 
 
 		 404 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  48.65 
 
 		 404 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  48.65 
 
 		 404 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  48.65 
 
 		 404 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  48.65 
 
 		 404 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  48.15 
 
 		 408 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  48.15 
 
 		 408 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0141  transposase, mutator type  49.06 
 
 		 266 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0155  hypothetical protein  47.22 
 
 		 408 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4398  transposase mutator type  46.85 
 
 		 400 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4677  transposase mutator type  46.85 
 
 		 400 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00238  transposase, Mutator family  44.44 
 
 		 261 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2905  transposase mutator type  47.22 
 
 		 435 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.482411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  45.79 
 
 		 416 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  45.79 
 
 		 416 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  43 
 
 		 422 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3995  transposase and inactivated derivatives-like  42.59 
 
 		 171 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  43 
 
 		 422 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1528  transposase mutator family protein  43 
 
 		 422 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  43 
 
 		 422 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  43 
 
 		 422 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3244  transposase mutator family protein  43 
 
 		 422 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  48.18 
 
 		 425 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  48.18 
 
 		 425 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  48.18 
 
 		 425 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  48.18 
 
 		 425 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  48.18 
 
 		 425 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0505  transposase  43 
 
 		 639 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.804069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1744  transposase mutator family protein  41.75 
 
 		 226 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2348  transposase mutator family protein  43 
 
 		 422 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>