93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3168 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3186    100 
 
 		 1161 bp  918    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3168    100 
 
 		 792 bp  1570    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0186296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1109    86.9 
 
 		 543 bp  432  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  82.12 
 
 		 1209 bp  404  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2225  transposase  84.12 
 
 		 423 bp  260  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.217285  hitchhiker  0.00000000170643 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2495    82.69 
 
 		 1155 bp  254  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.186831  hitchhiker  0.00000352345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  82.69 
 
 		 1209 bp  254  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  82.69 
 
 		 1209 bp  254  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  82.69 
 
 		 1209 bp  254  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  82.69 
 
 		 1209 bp  254  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  82.69 
 
 		 1209 bp  254  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  82.69 
 
 		 1209 bp  254  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  82.69 
 
 		 1209 bp  254  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  84.15 
 
 		 1209 bp  252  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  84.15 
 
 		 1209 bp  252  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  84.15 
 
 		 1209 bp  252  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  84.15 
 
 		 1209 bp  252  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  82.45 
 
 		 1209 bp  246  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2292  transposase mutator type  83.38 
 
 		 861 bp  236  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2073    83.38 
 
 		 1199 bp  236  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000839845  hitchhiker  0.0000707086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2436    82.21 
 
 		 1208 bp  230  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.636852  normal  0.0176396 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2179    83.1 
 
 		 1199 bp  228  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2068    81.23 
 
 		 858 bp  161  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2015    81.23 
 
 		 858 bp  161  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.005715 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1448    81.23 
 
 		 858 bp  161  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  82.53 
 
 		 870 bp  161  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1811    85.21 
 
 		 348 bp  137  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678865  hitchhiker  0.00000105926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4669    86.76 
 
 		 534 bp  127  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0952    83.53 
 
 		 507 bp  115  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000944257  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4584    85.29 
 
 		 534 bp  111  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0077  IS1414, transposase, truncation  88.76 
 
 		 285 bp  97.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.829264  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3217  hypothetical protein  87.64 
 
 		 123 bp  81.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0714  hypothetical protein  89.71 
 
 		 186 bp  79.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4788    86.05 
 
 		 264 bp  75.8  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4583    82.4 
 
 		 291 bp  73.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0951    82.4 
 
 		 198 bp  73.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00450587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4668    81.6 
 
 		 291 bp  65.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.753237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1103  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2748  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0926  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3131  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0431  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3772  transposase mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5562  transposase, mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1683  transposase, mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5297  transposase, mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1204  transposase, mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1201  transposase, mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0398  transposase, mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3279  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1191 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3771    90 
 
 		 1955 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2752    85.51 
 
 		 501 bp  58  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3412    88.68 
 
 		 1704 bp  58  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0356  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1260 bp  54  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0909  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1260 bp  54  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2936  transposase mutator type  89.36 
 
 		 1260 bp  54  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00238  transposase, Mutator family  90.48 
 
 		 786 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4398  transposase mutator type  93.75 
 
 		 1203 bp  48.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4677  transposase mutator type  93.75 
 
 		 1203 bp  48.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>