69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2752 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2752    100 
 
 		 501 bp  993    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1448    84.65 
 
 		 858 bp  323  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0952    84.65 
 
 		 507 bp  323  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000944257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2068    84.65 
 
 		 858 bp  323  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2015    84.65 
 
 		 858 bp  323  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.005715 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4584    81.94 
 
 		 534 bp  228  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4669    81.72 
 
 		 534 bp  220  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  81.84 
 
 		 1209 bp  172  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  81.84 
 
 		 1209 bp  172  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  81.84 
 
 		 1209 bp  172  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  81.84 
 
 		 1209 bp  172  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3186    82.84 
 
 		 1161 bp  167  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  80.29 
 
 		 1209 bp  159  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  80.29 
 
 		 1209 bp  159  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  80.29 
 
 		 1209 bp  159  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  80.29 
 
 		 1209 bp  159  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2495    80.05 
 
 		 1155 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.186831  hitchhiker  0.00000352345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  80.05 
 
 		 1209 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2436    80.05 
 
 		 1208 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.636852  normal  0.0176396 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0088  transposase  87.01 
 
 		 168 bp  147  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.310139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  79.81 
 
 		 1209 bp  143  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  79.81 
 
 		 1209 bp  143  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2179    79.17 
 
 		 1199 bp  119  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2073    79.17 
 
 		 1199 bp  119  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000839845  hitchhiker  0.0000707086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2292  transposase mutator type  78.92 
 
 		 861 bp  111  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1807  transposase  83.03 
 
 		 192 bp  105  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2496  transposase  94.12 
 
 		 150 bp  103  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  hitchhiker  0.0000545248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1258  transposase, Mutator family  93.02 
 
 		 678 bp  61.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1450    97.14 
 
 		 132 bp  61.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632019  normal  0.893196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3988  hypothetical protein  91.49 
 
 		 162 bp  61.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3168    85.51 
 
 		 792 bp  58  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0186296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2007    96.77 
 
 		 282 bp  54  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4667    90.7 
 
 		 180 bp  54  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.240506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4582    96.67 
 
 		 150 bp  52  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4059  hypothetical protein  100 
 
 		 114 bp  46.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.829682  normal  0.700029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>