65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4667 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4667    100 
 
 
180 bp  357  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.240506  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1258  transposase, Mutator family  95 
 
 
678 bp  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4582    96.67 
 
 
150 bp  258  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2436    90.56 
 
 
1208 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.636852  normal  0.0176396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  90.56 
 
 
1209 bp  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1450    95.35 
 
 
132 bp  200  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632019  normal  0.893196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2007    95.83 
 
 
282 bp  198  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  89.29 
 
 
1209 bp  190  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  89.29 
 
 
1209 bp  190  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  89.29 
 
 
1209 bp  190  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  89.29 
 
 
1209 bp  190  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2179    88.1 
 
 
1199 bp  174  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2291  transposase  88.1 
 
 
339 bp  174  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0059921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2073    88.1 
 
 
1199 bp  174  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000839845  hitchhiker  0.0000707086 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0066    86.9 
 
 
1031 bp  159  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2495    89.43 
 
 
1155 bp  133  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.186831  hitchhiker  0.00000352345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3186    85.12 
 
 
1161 bp  89.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3988  hypothetical protein  84.44 
 
 
162 bp  71.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4059  hypothetical protein  84.44 
 
 
114 bp  71.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.829682  normal  0.700029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  81.25 
 
 
870 bp  71.9  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  92 
 
 
1209 bp  67.9  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1564  transposase  92 
 
 
129 bp  67.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000376737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2752    90.7 
 
 
501 bp  54  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264491  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0107  TnpA  92.11 
 
 
123 bp  52  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221616  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1810    89.13 
 
 
258 bp  52  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581958  hitchhiker  0.00000102188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>