63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1450 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1450    100 
 
 		 132 bp  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632019  normal  0.893196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1258  transposase, Mutator family  96.9 
 
 		 678 bp  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4667    95.35 
 
 		 180 bp  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.240506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2007    96.67 
 
 		 282 bp  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4582    94.95 
 
 		 150 bp  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2495    89.34 
 
 		 1155 bp  139  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.186831  hitchhiker  0.00000352345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2436    88.62 
 
 		 1208 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.636852  normal  0.0176396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3186    88.7 
 
 		 1161 bp  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  88.62 
 
 		 1209 bp  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  88.03 
 
 		 1209 bp  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  88.03 
 
 		 1209 bp  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  88.03 
 
 		 1209 bp  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  88.03 
 
 		 1209 bp  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2179    84.48 
 
 		 1199 bp  79.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2291  transposase  84.48 
 
 		 339 bp  79.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0059921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2073    84.48 
 
 		 1199 bp  79.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000839845  hitchhiker  0.0000707086 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0066    83.62 
 
 		 1031 bp  71.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  100 
 
 		 870 bp  63.9  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2752    97.14 
 
 		 501 bp  61.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3988  hypothetical protein  96.97 
 
 		 162 bp  58  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4059  hypothetical protein  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.829682  normal  0.700029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1810    94.12 
 
 		 258 bp  52  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581958  hitchhiker  0.00000102188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2242  hypothetical protein  86.96 
 
 		 177 bp  44.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00471731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>