124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3186 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  85.03 
 
 		 1209 bp  916    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  85.03 
 
 		 1209 bp  916    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  82.74 
 
 		 1209 bp  684    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  82.74 
 
 		 1209 bp  684    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2179    82.27 
 
 		 1199 bp  672    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  85.03 
 
 		 1209 bp  916    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  82.57 
 
 		 1209 bp  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  82.57 
 
 		 1209 bp  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  82.57 
 
 		 1209 bp  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2073    82.36 
 
 		 1199 bp  680    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000839845  hitchhiker  0.0000707086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  82.74 
 
 		 1209 bp  684    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2436    82.57 
 
 		 1208 bp  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.636852  normal  0.0176396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2495    82.81 
 
 		 1155 bp  698    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.186831  hitchhiker  0.00000352345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  82.57 
 
 		 1209 bp  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  82.57 
 
 		 1209 bp  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  82.57 
 
 		 1209 bp  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  82.65 
 
 		 1209 bp  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  82.83 
 
 		 1209 bp  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  82.83 
 
 		 1209 bp  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  82.83 
 
 		 1209 bp  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  82.83 
 
 		 1209 bp  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3168    100 
 
 		 792 bp  918    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0186296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3186    100 
 
 		 1161 bp  2302    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  85.03 
 
 		 1209 bp  916    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2292  transposase mutator type  82.34 
 
 		 861 bp  498  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121086  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2068    81.5 
 
 		 858 bp  426  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1109    86.17 
 
 		 543 bp  416  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1448    81.38 
 
 		 858 bp  418  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2015    81.38 
 
 		 858 bp  418  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.005715 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  82.34 
 
 		 1209 bp  353  7e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4584    83.1 
 
 		 534 bp  323  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0952    82.7 
 
 		 507 bp  307  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000944257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4669    82.5 
 
 		 534 bp  299  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2291  transposase  84.93 
 
 		 339 bp  222  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0059921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1258  transposase, Mutator family  81.14 
 
 		 678 bp  222  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  81.01 
 
 		 870 bp  198  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0066    86.28 
 
 		 1031 bp  194  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2007    84.36 
 
 		 282 bp  172  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2752    82.84 
 
 		 501 bp  167  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1807  transposase  85.21 
 
 		 192 bp  137  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1811    85.21 
 
 		 348 bp  137  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678865  hitchhiker  0.00000105926 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0088  transposase  85.71 
 
 		 168 bp  131  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.310139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1450    88.7 
 
 		 132 bp  125  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632019  normal  0.893196 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2496  transposase  87.2 
 
 		 150 bp  121  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  hitchhiker  0.0000545248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0951    82.2 
 
 		 198 bp  109  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00450587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2014    87.37 
 
 		 147 bp  93.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2067    87.37 
 
 		 147 bp  93.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.843417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4788    80.71 
 
 		 264 bp  89.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494188 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4667    85.12 
 
 		 180 bp  89.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.240506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1449    86.32 
 
 		 147 bp  85.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.885432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4583    82.84 
 
 		 291 bp  83.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1810    85.71 
 
 		 258 bp  83.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581958  hitchhiker  0.00000102188 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4668    86.02 
 
 		 291 bp  81.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.753237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0714  hypothetical protein  89.71 
 
 		 186 bp  79.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2225  transposase  85.26 
 
 		 423 bp  77.8  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.217285  hitchhiker  0.00000000170643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4582    85.71 
 
 		 150 bp  75.8  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2550a    97.37 
 
 		 855 bp  67.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0431  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0926  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1103  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2748  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3131  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3279  transposase mutator family protein  90 
 
 		 1191 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0398  transposase, mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1204  transposase, mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5297  transposase, mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1683  transposase, mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5562  transposase, mutator type  90 
 
 		 1260 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  87.93 
 
 		 1227 bp  60  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  87.93 
 
 		 1227 bp  60  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  87.93 
 
 		 1227 bp  60  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  87.93 
 
 		 1227 bp  60  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>