110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0714 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0714  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  88 
 
 
402 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  88 
 
 
402 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  88 
 
 
402 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  88 
 
 
402 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  88 
 
 
402 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2292  transposase mutator type  84 
 
 
286 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121086  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  76.67 
 
 
289 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  84 
 
 
402 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  76 
 
 
402 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0885  transposase mutator family protein  76 
 
 
404 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.767788  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1983  transposase mutator family protein  76 
 
 
404 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.365641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0106  transposase, mutator type  72 
 
 
393 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  72 
 
 
404 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  72 
 
 
404 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  72 
 
 
404 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  72 
 
 
404 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  72 
 
 
404 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  72 
 
 
404 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  72 
 
 
404 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  72 
 
 
404 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  72 
 
 
404 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  72 
 
 
404 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  72 
 
 
404 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0930  transposase, mutator type  76 
 
 
259 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385661  hitchhiker  0.00180839 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0957  transposase, mutator type  76 
 
 
259 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209569  unclonable  0.0000397615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0141  transposase, mutator type  72 
 
 
266 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066398  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3212  transposase, mutator type  64 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3247  transposase, mutator type  64 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203349  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3387  transposase, mutator type  64 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3615  transposase, mutator type  64 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0287  transposase, mutator type  64 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0776  transposase, mutator type  64 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0805  transposase, mutator type  64 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  64 
 
 
408 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  64 
 
 
408 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1379  transposase, mutator type  64 
 
 
366 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2796  transposase, mutator type  64 
 
 
366 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520079  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1364  transposase, mutator type  72 
 
 
268 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.29614 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3613  transposase, mutator type  64 
 
 
375 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230884  normal  0.701856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00515  IS1113 tranposase  68 
 
 
331 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0127136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03663  IS1113 transposase  68 
 
 
331 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  64 
 
 
407 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  64 
 
 
407 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  60 
 
 
403 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1218  transposase, mutator type  60 
 
 
411 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  64 
 
 
408 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  64 
 
 
408 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  64 
 
 
408 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  60 
 
 
407 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00428  IS1113 transposase  64 
 
 
331 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00578  IS1113 transposase  64 
 
 
331 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01463  IS1113 transposase  64 
 
 
331 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01962  IS1113 transposase  64 
 
 
331 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00540363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03164  IS1113 transposase  64 
 
 
331 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.800194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03988  IS1113 transposase  64 
 
 
331 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05637  IS1113 transposase  64 
 
 
331 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06261  IS1113 transposase  64 
 
 
331 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.190082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  64 
 
 
408 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  60 
 
 
406 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>