More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00515 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00578  IS1113 transposase  99.7 
 
 
331 aa  677    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03164  IS1113 transposase  99.09 
 
 
331 aa  673    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.800194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01962  IS1113 transposase  98.79 
 
 
331 aa  670    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00540363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01463  IS1113 transposase  98.79 
 
 
331 aa  670    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03988  IS1113 transposase  99.09 
 
 
331 aa  673    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05637  IS1113 transposase  99.4 
 
 
331 aa  675    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06261  IS1113 transposase  99.4 
 
 
331 aa  675    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.190082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03663  IS1113 transposase  99.4 
 
 
331 aa  675    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00428  IS1113 transposase  99.09 
 
 
331 aa  673    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00515  IS1113 tranposase  100 
 
 
331 aa  679    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0127136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  56.4 
 
 
408 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  56.4 
 
 
408 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  55.15 
 
 
408 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  52.74 
 
 
404 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  52.74 
 
 
404 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  53.05 
 
 
404 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  52.74 
 
 
404 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  52.74 
 
 
404 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  52.74 
 
 
404 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  55.15 
 
 
408 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  55.15 
 
 
408 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  52.74 
 
 
404 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  52.74 
 
 
404 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  52.74 
 
 
404 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  53.05 
 
 
404 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  53.05 
 
 
404 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  54.85 
 
 
408 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  52.32 
 
 
402 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  52.32 
 
 
402 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  53.25 
 
 
402 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  54.85 
 
 
408 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  54.85 
 
 
408 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  52.32 
 
 
402 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  54.85 
 
 
408 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  52.32 
 
 
402 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  52.32 
 
 
402 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  51.08 
 
 
403 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0885  transposase mutator family protein  52.01 
 
 
404 aa  368  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.767788  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1983  transposase mutator family protein  52.01 
 
 
404 aa  368  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.365641 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  52.32 
 
 
402 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2905  transposase mutator type  51.71 
 
 
435 aa  358  6e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.482411  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0106  transposase, mutator type  53.97 
 
 
393 aa  358  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1218  transposase, mutator type  51.07 
 
 
411 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  49.07 
 
 
425 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  50.94 
 
 
411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  50.94 
 
 
411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  48.15 
 
 
426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  48.77 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  48.15 
 
 
426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  48.15 
 
 
426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  48.77 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  48.46 
 
 
425 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0630  ISCpe3, transposase  46.44 
 
 
407 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4398  transposase mutator type  48.45 
 
 
400 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4677  transposase mutator type  48.45 
 
 
400 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  48.46 
 
 
425 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5742  transposase mutator type  50.31 
 
 
419 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4789  transposase mutator type  50.31 
 
 
419 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0356  transposase mutator type  50.31 
 
 
419 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  50.31 
 
 
419 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>