239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0077 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0077  IS1414, transposase, truncation  100 
 
 		 94 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.829264  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  97.53 
 
 		 402 aa  166  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2225  transposase  90.24 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.217285  hitchhiker  0.00000000170643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  64.63 
 
 		 402 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  64.63 
 
 		 402 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  64.63 
 
 		 402 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  64.63 
 
 		 402 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  60.98 
 
 		 402 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  60.98 
 
 		 402 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2292  transposase mutator type  60.98 
 
 		 286 aa  105  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  60.98 
 
 		 402 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  60.98 
 
 		 402 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  59.76 
 
 		 402 aa  103  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  59.76 
 
 		 402 aa  103  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1807  transposase  65.38 
 
 		 63 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473053  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0088  transposase  60 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.310139  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  41.18 
 
 		 411 aa  63.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  41.18 
 
 		 411 aa  63.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  43.59 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  43.59 
 
 		 419 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  43.59 
 
 		 419 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  43.59 
 
 		 419 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  43.59 
 
 		 419 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  42.31 
 
 		 426 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  50.91 
 
 		 416 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  42.31 
 
 		 426 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  42.31 
 
 		 426 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  33.75 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0885  transposase mutator family protein  33.75 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.767788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1983  transposase mutator family protein  33.75 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0155  hypothetical protein  41.03 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  39.29 
 
 		 416 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  39.29 
 
 		 416 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  39.29 
 
 		 416 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  39.29 
 
 		 416 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  38.1 
 
 		 416 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  38.1 
 
 		 416 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0929  transposase mutator family protein  35.06 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.87774  hitchhiker  0.00163445 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0958  transposase mutator family protein  35.06 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0510874  unclonable  0.0000341963 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3783  transposase, mutator type  43.42 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000372197  decreased coverage  0.000919258 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  38.55 
 
 		 416 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  38.55 
 
 		 416 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  43.04 
 
 		 408 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  43.04 
 
 		 408 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  43.21 
 
 		 408 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  43.21 
 
 		 408 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  43.21 
 
 		 408 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  43.21 
 
 		 408 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  43.21 
 
 		 408 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  43.21 
 
 		 408 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  43.21 
 
 		 408 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  38.55 
 
 		 416 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  38.55 
 
 		 416 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  38.55 
 
 		 416 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  38.55 
 
 		 416 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2496  transposase  60.87 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  hitchhiker  0.0000545248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  38.55 
 
 		 416 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  38.46 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1793  transposase mutator type  50.91 
 
 		 419 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1787  transposase mutator type  50.91 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.452427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  38.46 
 
 		 425 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  38.55 
 
 		 416 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  38.46 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  38.55 
 
 		 416 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  38.55 
 
 		 416 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>